{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555901282832061],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.0005554618392000862],
[520.2931259852755, 1221.908236859675, 1, 0, 0.2986412116769648, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986412116769648, 0.000555433631729556],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005559573461408557],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.00055540940114453],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.00055618526043223],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0005556026000850723],
[520.2931259852757, 1221.957022763958, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081597, 1, 0.2986328492259254, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556024104717835],
[520.3515580987508, 1221.767458647991, 1, 0, 0.2986888686115503, 0.001921777660575819, 0, -0.008334145327376429, 1, 0.2986888686115503, 0.0005552746100982557],
[520.4588190077809, 1221.660197738961, 0, 1, 0.2987504378315628, 0, 0.0008185582225325765, 0.003549829579901229, 0.7012495621684371, 1, 0.0005554094011571952],
[520.5018546535383, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2986961530502496, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7013038469497503, 1, 0.0005555862031590382],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555602599302923],
[520.3887270764076, 1221.975401261799, 1, 0, 0.2986681822775658, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986681822775659, 0.0005554094011571952],
[520.4206636804612, 1221.698353066281, 0, 1, 0.2987285361549535, 0, 0.000818532657828464, 0.003549718713819425, 0.7012714638450466, 1, 0.0005561858220865329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556025988044274],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554618390693882],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 1, 0, 0.2987034639457931, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987034639457931, 0.0005559567569260764],
[520.3887270764076, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986877214216319, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013122785783681, 1, 0.000555433631729556],
[520.0169298016, 1222.070150341088, 1, 0, 0.2985022595764887, 0.001923014314902259, 0, -0.008339508308270478, 1, 0.2985022595764888, 0.0005555776574806229],
[520.3865856016128, 1221.732431145129, 0, 1, 0.2987089748743976, 0, 0.0008185098262986279, 0.003549619700654893, 0.7012910251256024, 1, 0.0005557008672273207],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855174017367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.2683443811159, 1220.687603759081, 0, 1, 0.299243126634545, 0, 0.0008192104162609021, 0.003552657938990302, 0.700756873365455, 1, 0.0005551659200198466],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.0005553501853148444],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555774635455052],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618391986052],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555496723140319],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552959182378329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554094010246092],
[520.5018546535383, 1221.862273684668, 0, 1, 0.2987331099096783, 0, 0.0008184228464509206, 0.003549242496409982, 0.7012668900903217, 1, 0.0005553132697065267],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005553492965555406],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555735002557171],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005554395042848172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555101137701484],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 1, 0, 0.2989746461734846, 0.001919940712388245, 0, -0.008326179060795144, 1, 0.2989746461734846, 0.0005557088504503228],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005555776574806229],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553226989291138],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025992407542],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556543432654705],
[520.2256584698628, 1221.730289670334, 0, 1, 0.298644554717519, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7013554452824811, 1, 0.0005557004187918396],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013833994870571, 1, 0.0005556025987919047],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005555776574917911],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552745568188016],
[520.2597365487112, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986361617934989, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2986361617934989, 0.0005556024712497937],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555735002557171],
[520.4280375288591, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987327688441826, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012672311558175, 1, 0.0005554174860284007],
[519.960442597654, 1222.240920247297, 0, 2, 0.2984502559156409, 0, 0.001636338603027084, 0.007096285903509602, 0.4921720434248296, 1, 0.001111192831949263],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556150504161874],
[520.3887270764076, 1221.732431145129, 1, 0, 0.2987098369252642, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987098369252642, 0.0005554094011571952],
[520.4206636804612, 1221.698353066281, 0, 1, 0.2987285361549535, 0, 0.000818532657828464, 0.003549718713819425, 0.7012714638450466, 1, 0.0005555707526764496],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553977329719376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553715227040915],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553449999921616],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005554094011571952],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175340027],
[520.428037528859, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987327688441825, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012672311558175, 1, 0.000555957346170339],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618391874846],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855175340027],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552745591787581],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005556541546165754],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554854006487144],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.000555274556795432],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555734417777794],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555860044177617],
[520.0625898633181, 1221.829485068772, 0, 1, 0.29856188988264, 0, 0.000818444809378384, 0.003549337742719193, 0.7014381101173599, 1, 0.0005553762790156145],
[520.2713185315807, 1221.866171105263, 0, 1, 0.2986396433269074, 0, 0.0008184202359047477, 0.00354923117529223, 0.7013603566730926, 1, 0.0005667452210951124],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005554596331842042],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005552858878987155],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556543445785046],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552746100982557],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025992407542],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618390567873],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005556025993049479],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877825, 0, 0.0008185922196038123, 0.003549977014507321, 0.7012332935122174, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618391874846],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556024112627105],
[520.3780964994451, 1222.201609794845, 0, 1, 0.2986251329679852, 0, 0.0008181956168163261, 0.003548257072946983, 0.7013748670320148, 1, 0.000555957348005022],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555735002557171],
[520.3908685512024, 1221.728148195539, 0, 1, 0.2987114333456894, 0, 0.0008185126957064661, 0.003549632144374278, 0.7012885666543105, 1, 0.0005554174860146608],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005554766281183761],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 2, 0.2986166005129429, 0, 0.001636804052049527, 0.007098304409539254, 0.4919386730760207, 1, 0.001111578198172207],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.0005554618391986052],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005556026000850723],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552746100982557],
[520.2931259852755, 1221.957022763957, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986328492259253, 0.000555409401030367],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554855175712375],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554094011502876],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986822463773925, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013177536226075, 1, 0.0005554855174497603],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554053558074996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.112530892732, 1221.843417247465, 1, 0, 0.2985796118713744, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985796118713744, 0.0005554828230661217],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554673873214233],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005555901283124398],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005556543427496656],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556025992407542],
[520.1235112041988, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985438550885164, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014561449114836, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618392015607],
[520.5124852305007, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009283, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987600194009283, 0.0005554855177202657],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005559567569260764],
[520.3887270764076, 1221.732431145129, 1, 0, 0.2987098369252642, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987098369252642, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554336315987333],
[520.2042337125346, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985763545901647, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014236454098353, 1, 0.0005553226993871776],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555733311365753],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555735002557171],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555860044177617],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938712231491e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.21393870733721e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938728508696e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632069671654999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1264630714253, 1221.992553675316, 0, 0, 0.2985596610056625, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938673014679e-05],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0004632069682482123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.636243384594, 1221.482773362148, 0, 0, 0.2988522818359663, 0, 0, 0, 1, 1, 9.17770004444551e-05],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0004634762362195322],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.252114424820738e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.000462798104752266],
[520.8887270764076, 1221.269600122786, 0, 2, 0.2989904642672874, 0, 0.001637640042623611, 0.007101929837745474, 0.4914143691881933, 1, 0.001112181234678041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555189491597179],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 1, 1, 0.2986166005129429, 0.001922242749312472, 0.0008184020260247633, -0.00478701006619029, 0.9108281258980934, 0.5080613269239793, 0.001111648058778775],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005555775403496881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555433631729556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8887270764076, 1221.230289670334, 0, 1, 0.2989972109076237, 0, 0.0008188463784909442, 0.0035510792216695, 0.7010027890923762, 1, 0.0005552394118214587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.4016720393162, 1219.479471356238, 0, 1.75, 0.2986987776663493, 0, 0.001435038507088394, 0.006223310694990845, 0.537443782121706, 1, 0.0005563573276054347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0001973933391558065],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001819953934752114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001760029570302874],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554301656523966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.9633944648806, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2984660574085619, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.7015339425914381, 1, 0.0005555191180202036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005553894551468868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0625898633181, 1222.017116430972, 0, 1, 0.2985297331599037, 0, 0.0008183191434507919, 0.003548792769112341, 0.7014702668400963, 1, 0.0005556176298501161],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005552607160069428],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555705445778651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555595078526979],
[520.3186351450342, 1221.718035503499, 0, 1, 0.2986840885222742, 0, 0.0008185194708923787, 0.003549661526224829, 0.7013159114777258, 1, 0.0005556543431565573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005554435419429481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001057876766186888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000449545515748905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005556025987919047],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005552746100982557],
[520.4588190077809, 1221.660197738961, 0, 1, 0.2987504378315628, 0, 0.0008185582225325765, 0.003549829579901229, 0.7012495621684371, 1, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556803623052874],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 0, 0.2985681263841206, 0, 0, 0, 1, 1, 7.838792467668707e-05],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0004769308816165886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.845437245776999e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004768913566201378],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 0, 0.2985681263841206, 0, 0, 0, 1, 1, 8.2113119399976e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0004731988613756392],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553769327911654],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005553986181400587],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005554995256854142],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005558772098246158],
[519.1759720886924, 1219.849453917388, 0, 2.75, 0.2985442100642853, 0, 0.002254376547178615, 0.009776522098392044, 0.3771384717368871, 1, 0.001162305765458296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555331499809871],
[520.3887270764076, 1221.48517807887, 1, 0, 0.2987522377689091, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987522377689091, 0.0005553271991007588],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556323844420768],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552959182378329],
[519.6936031355721, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938981536108e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632069645743729],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213939166568673e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004632069645763206],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.404152457245, 0, 0, 0.2987661352799516, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213939277052931e-05],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0004632069634916608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213875773749451e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004632075949190324],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5586681047466, 1222.481727737092, 0, 0, 0.2986498014312122, 0, 0, 0, 1, 1, 8.048275344738785e-05],
[520.4736975905771, 1222.106008703713, 0, 1, 0.2986799947862347, 0, 0.0008182596214060833, 0.003548534640723734, 0.7013200052137653, 1, 0.0002510115303943005],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002237795207283645],
[520.3499394364839, 1222.014188901722, 1, 1, 0.2986459207770604, 0.001921783638685451, 0.0008183211038643861, -0.004785369981748263, 0.9108106140032217, 0.5081024555573426, 0.001111574034604539],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.000555457803880097],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 1, 0, 0.2985229969158424, 0.001922845479546641, 0, -0.00833877612243078, 1, 0.2985229969158424, 0.0005552665517173837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555101137588717],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.00055541521525467],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3101061715045, 1220.808910575237, 0, 0, 0.2992390882369256, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938716170292e-05],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0004632069671674485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.127337239775637e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004639559922145829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.285582017924411e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004624746017678244],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938768975218e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.214002526585796e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632063345554032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3887270764076, 1220.730289670334, 0, 0, 0.2992842177052039, 0, 0, 0, 1, 1, 9.1273374445242e-05],
[520.8887270764076, 1221.230289670334, 0, 1, 0.2989972109076237, 0, 0.0008188463784909442, 0.0035510792216695, 0.7010027890923762, 1, 0.0004639559922124692],
[520.5665116218895, 1221.488631916745, 0, 1, 0.2988232109372057, 0, 0.0008186731942243393, 0.003550328175970557, 0.7011767890627943, 1, 0.0005553297054365637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877824, 0, 0.0008185922196038122, 0.003549977014507321, 0.7012332935122176, 1, 0.0005555409291510383],
[520.5666742657486, 1221.552342480994, 0, 2, 0.2988123482159458, 0, 0.00163726099197515, 0.007100286014292056, 0.4916641230144362, 1, 0.001111530300891085],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7148642894971, 1221.404152457245, 0, 0, 0.2988974113042446, 0, 0, 0, 1, 1, 9.127337436547862e-05],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0004639559922145829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.651668765431, 1, 0, 0.2987236853511255, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987236853511255, 0.000555590126588173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005554348051913349],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552787805913678],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005553246961714765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005553611561284307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.7164899496048, 1219.409665797664, 0, 1.75, 0.2988377169948851, 0, 0.00143512065639996, 0.006223666950719686, 0.5372574621437258, 1, 0.0005562888386168968],
[520.5411651059899, 1221.577851640752, 0, 1, 0.2987977056114432, 0, 0.0008186134012309231, 0.003550068872562617, 0.7012022943885567, 1, 0.0005556110053317355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5177176041038, 1221.601299142638, 1, 0, 0.2987842464265881, 0.001921164191303439, 0, -0.008331484904074199, 1, 0.2987842464265881, 0.0005555659344509957],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005556822944319406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.000555802808071971],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554768958389287],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005555792729203302],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000274149647016208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0002812966606447634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 1, 0.2985681263841206, 0, 0.0008183454683935376, 0.003548906932110006, 0.7014318736158794, 1, 0.0005556483494881582],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0003186747082174198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002366842773700248],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618393341495],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005559573461408557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554336316113185],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.5305345290274, 1222.588482217714, 0, 2, 0.298217589920582, 0, 0.001635873418643778, 0.007094268545136656, 0.4924985510968764, 1, 0.001111530824568323],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005554789486818578],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.00055521546289574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552819257250268],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555474211859809],
[519.1288774150106, 1219.997382362487, 1, 0.75, 0.2984998211006414, 0.00192630393627778, 0.0006147554173826572, -0.005687773452992545, 0.9381188349853651, 0.4622893655657994, 0.0005567255410983363],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005554946737082099],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554187591706149],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005553717158904792],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552256445258485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001402911907074352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004149784183046178],
[520.1412107682211, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986105522923269, 0.001922554835682127, 0, -0.008337515691395984, 1, 0.2986105522923268, 0.0005555973887458151],
[520.0280831910903, 1221.598305656001, 0, 1, 0.2985876227652561, 0, 0.0008185996946541263, 0.003550009431449678, 0.7014123772347439, 1, 0.0005558470542497018],
[520.0174526141278, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2985607157624773, 0.001923012381551811, 0, -0.008339499923937609, 1, 0.2985607157624772, 0.0005554644541540603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2986105522923269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001588742361793284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0003965721262535662],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005553659638966199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001764029564083005],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003789922321996802],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555787775782344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003166756665944955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000238706889437675],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552430157340665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552161350462654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553895570536849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005553684831416423],
[520.2649689223143, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986154240543165, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986154240543164, 0.0005552353481373434],
[520.3887270764076, 1221.953243222865, 0, 1, 0.2986719805567349, 0, 0.0008183619181389706, 0.003548978269482612, 0.7013280194432651, 1, 0.0005555186061767025],
[520.2597365487112, 1222.121544203013, 1, 0, 0.2985912109456623, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2985912109456623, 0.0005552546062128689],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554556134903032],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.0005553747991628765],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552117849055502],
[521.3101061715045, 1221.07117458022, 0, 0, 0.2991940466363327, 0, 0, 0, 1, 1, 8.06444577776325e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.849416623956, 1221.531864127768, 0, 1, 0.2989296443768286, 0, 0.0008186442199066561, 0.003550202523466999, 0.7010703556231714, 1, 0.0004745834763497002],
[520.112530892732, 1222.105681252447, 1, 0, 0.2985346653289324, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985346653289325, 0.0005554496924000088],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554618102613063],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554819669096104],
[520.0411651059899, 1222.340115645734, 0, 1, 0.2984657668507699, 0, 0.0008181029054026612, 0.003547855012703054, 0.7015342331492301, 1, 0.0005555227580253764],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552822945524],
[520.2256584698628, 1222.123685677808, 0, 1, 0.2985771253148713, 0, 0.0008182477859803408, 0.003548483314204454, 0.7014228746851288, 1, 0.0005552006282204217],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552693013038378],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553415173501674],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005555296518076105],
[520.2575950739164, 1222.123685677808, 0, 1, 0.2985899818950415, 0, 0.0008182477859803408, 0.003548483314204454, 0.7014100181049585, 1, 0.0005554739103041332],
[520.2649689223143, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986154240543165, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986154240543164, 0.0005555061359821627],
[520.5732204402805, 1221.68430215735, 0, 1, 0.298792350549951, 0, 0.0008185420719854697, 0.003549759540057668, 0.701207649450049, 1, 0.0005552296700042045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554618102668969],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554936682909325],
[520.2256584698629, 1222.155622281861, 0, 1, 0.298571652609479, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.701428347390521, 1, 0.0005550903996224672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005553712793402099],
[520.0169298016, 1222.33241434607, 1, 0, 0.2984573280601107, 0.001923014314902259, 0, -0.008339508308270478, 1, 0.2984573280601107, 0.0005552214348395948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1222.370897124656, 0, 1, 0.2986004035496119, 0, 0.0008180823041126617, 0.003547765671387298, 0.7013995964503881, 1, 0.0005555221715379196],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005554644032464625],
[520.4776193491485, 1221.871724798522, 0, 1, 0.2987217351660083, 0, 0.0008184165159930295, 0.003549215043204996, 0.7012782648339917, 1, 0.0005554769844063478],
[520.5732204402805, 1221.644991704899, 0, 1, 0.29879909233603, 0, 0.0008185684112734123, 0.003549873765265941, 0.70120090766397, 1, 0.0005551632507060876],
[520.349416623956, 1222.031864127768, 0, 1, 0.2986426807796392, 0, 0.0008183092678305532, 0.003548749941653184, 0.7013573192203608, 1, 0.0005552349215777377],
[520.9600928631497, 1221.297429734481, 1, 0, 0.2990144029261649, 0.001919532827368964, 0, -0.008324410191743702, 1, 0.2990144029261649, 0.0005554015087588116],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7362890468253, 1221.644991704899, 0, 1, 0.2988647173838791, 0, 0.0008185684112734123, 0.003549873765265941, 0.7011352826161209, 1, 0.0005552677729909946],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553213233001295],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553212298479675],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005551514477548913],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.000555325291406555],
[520.2931259852755, 1222.088154766449, 1, 0, 0.2986103740513115, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986103740513115, 0.0005551554843117387],
[520.4588190077809, 1222.004807842152, 0, 1, 0.2986913534308195, 0, 0.0008183273859337968, 0.003548828514168926, 0.7013086465691805, 1, 0.0005551595187699849],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.000555449692372271],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005554618102645038],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553698356948083],
[519.5804755584413, 1222.800805193283, 0, 2, 0.2982013645912657, 0, 0.001635589371143625, 0.007093036720459581, 0.4925213246615616, 1, 0.001111446358809112],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553940304522529],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005553344460521285],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 1, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0.0008182527230187122, -0.004787027678266735, 0.9108414953972752, 0.5080299232916036, 0.001111359901358742],
[520.303756562238, 1221.616834641937, 0, 2, 0.2986954509806651, 0, 0.001637174556935613, 0.007099911172708838, 0.4918280704752125, 1, 0.00111138439654859],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.0005553030658857172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 2, 0.2986652421173245, 0, 0.001636671184275809, 0.007097728203790686, 0.4918704426143511, 1, 0.00111107770685395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 0, 0.2986652421173245, 0, 0, 0, 1, 1, 7.412131609356205e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0004810424629815433],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005551542812476962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552259629362498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005549799814143922],
[520.3887270764076, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986877214216319, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013122785783681, 1, 0.0005552012975161785],
[520.463065031721, 1221.655951715021, 0, 0, 0.2987528751070298, 0, 0, 0, 1, 1, 7.271047767915134e-07],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4258960540643, 1221.693120692678, 1, 0, 0.2987315396085367, 0.001921503152671933, 0, -0.008332954872928218, 1, 0.2987315396085366, 0.0005545818026755786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6509910813897, 1221.468025665352, 1, 0, 0.2988607472144245, 0.001920672421890535, 0, -0.008329352254788707, 1, 0.2988607472144245, 0.0005553212124155475],
[520.5198590788987, 1221.599157667843, 0, 1, 0.298785475662234, 0, 0.0008185991237167365, 0.003550006955473775, 0.701214524337766, 1, 0.0005554585418136157],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555367877880637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552503723296946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552230866775041],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555303117605053],
[520.0625898633181, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985339423911206, 0.001922845479546641, 0, -0.00833877612243078, 1, 0.2985339423911206, 0.0005552614497476221],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552467819008582],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556213813739458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005552844444071551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552150668020542],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005553617865854827],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555021417598204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7600015386872, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2988808563865306, 0.001920270368394855, 0, -0.008327608675221145, 1, 0.2988808563865306, 0.0005550857162922876],
[520.5124852305007, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009283, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987600194009283, 0.0005551777885190134],
[519.7165862143407, 1219.898354565628, 0, 1.75, 0.2987538069668004, 0, 0.001434545750021219, 0.006221173762559392, 0.537369983592237, 1, 0.0005556164009611207],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555377851797115],
[520.7577138041534, 1221.113786634402, 1, 0, 0.2989644837021794, 0.001920278804311827, 0, -0.008327645259140011, 1, 0.2989644837021794, 0.000555435640936573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005554649229529651],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555776574917911],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005556803618233823],
[520.5411651059899, 1221.822963232217, 0, 1, 0.298755671469465, 0, 0.0008184491780663501, 0.003549356688344979, 0.701244328530535, 1, 0.0005555862028041344],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556499943930002],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553867525559949],
[520.0027049173322, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985098279414609, 0.001923066919736458, 0, -0.008339736438892518, 1, 0.2985098279414609, 0.0005555130033778827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1264630714253, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985596610056625, 0.001922609347916753, 0, -0.008337752093813811, 1, 0.2985596610056624, 0.0005554476647414843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005553446407839529],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005555409083694843],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555409401037276],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.00055532269947242],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.000818717829516724, 0.003550521745196121, 0.7011626651263967, 1, 0.0005556025988031366],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005555776572943883],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005559573461408557],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.0005554336315959765],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554578040130566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8386224435903, 1221.280394303152, 1, 0, 0.2989684501672061, 0.001919980502421948, 0, -0.008326351617657608, 1, 0.2989684501672061, 0.0005552905785617186],
[520.5517956829523, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554898532779007],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556667897517332],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618390582678],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556024112627105],
[519.9280375288591, 1222.190979217883, 1, 0, 0.2984457620466024, 0.001923343093311243, 0, -0.008340934116831575, 1, 0.2984457620466023, 0.0005552740471435397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1307460210149, 1221.988270725727, 1, 0, 0.2985621194769544, 0.001922593516437878, 0, -0.00833768343766883, 1, 0.2985621194769543, 0.0005556269684441971],
[520.2597365487112, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986361617934989, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2986361617934989, 0.0005555864067407712],
[520.0433065807847, 1222.075710165957, 1, 0, 0.2985119280495089, 0.001922916778940712, 0, -0.008339085325479674, 1, 0.298511928049509, 0.0005557971161970443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1264630714253, 1220.992553675316, 1, 0, 0.2991336746008229, 0.001918920014359241, 0, -0.008321752614446227, 1, 0.2991336746008229, 0.0005553985064105052],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005555508069279954],
[520.5411651059899, 1221.577851640752, 0, 1, 0.2987977056114432, 0, 0.0008186134012309231, 0.003550068872562617, 0.7012022943885567, 1, 0.0005553876634978208],
[519.3887270764075, 1222.690979217883, 0, 1, 0.2981429180305639, 0, 0.0008178681424800146, 0.003546836919738944, 0.7018570819694361, 1, 0.0005556182642458993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.3887270764075, 1222.730289670334, 1, 0, 0.2981361905148832, 0.00192534020834243, 0, -0.008349594976642182, 1, 0.2981361905148832, 0.0005553469329656031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.3887270764075, 1222.730289670334, 0, 0, 0.2981361905148832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001720310692428251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.000383342772630941],
[520.7577138041535, 1221.07447618195, 0, 1, 0.2989712308671411, 0, 0.0008189508662295482, 0.003551532352131113, 0.7010287691328589, 1, 0.0005555998767471024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.000818717829516724, 0.003550521745196121, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555019404593493],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005553048710789017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005554815701922888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553490116627893],
[520.3887270764076, 1221.404152457245, 0, 1, 0.2987661352799516, 0, 0.0008187298184537694, 0.003550573737445644, 0.7012338647200484, 1, 0.0005552990958882642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005558790718264308],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554618391986052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7577138041535, 1221.035165729499, 0, 0, 0.2989779783366557, 0, 0, 0, 1, 1, 7.587407110075193e-05],
[520.5732204402805, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298844078689861, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701155921310139, 1, 0.0004794276741451905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553537602853968],
[520.112530892732, 1221.843417247465, 1, 0, 0.2985796118713744, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985796118713744, 0.0005555971445826407],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855175712375],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759045, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7013123606240955, 1, 0.0005561858242558915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 0, 0, 0.2985229969158424, 0, 0, 0, 1, 1, 7.590028863961505e-05],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0004794029372801319],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554174859159596],
[519.8566717421169, 1222.294281608679, 1, 2, 0.2983993268449222, 0.001923607129343655, 0.001636267165847959, -0.00124610305513627, 0.7860137653875947, 0.6546416258363099, 0.001670189162536517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553965154893533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.00055540535580907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581598607786567e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000479484727552507],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554699035383493],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005555734417777794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581598723176314e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004794847274531345],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005554174859159596],
[520.2931259852755, 1221.957022763957, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986328492259253, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556707755684321],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002093167902014573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003460066739106921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4062300751643, 1221.742320306959, 0, 2, 0.2987151870378782, 0, 0.001637006402051708, 0.007099181937860958, 0.4918003888913181, 1, 0.001113602444671284],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005553112836794161],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555409401030367],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005554578038856568],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3101061715045, 1220.808910575237, 0, 0, 0.2992390882369256, 0, 0, 0, 1, 1, 7.723763124581473e-05],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 1, 0, 0.2989746461734846, 0.001919940712388245, 0, -0.008326179060795144, 1, 0.2989746461734846, 0.000478688899644126],
[520.3186351450341, 1221.800381601708, 0, 1, 0.2986699703885241, 0, 0.000818464304855642, 0.003549422288472861, 0.7013300296114759, 1, 0.0005556624627871544],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554578040316878],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175712375],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 2, 0.2987169445784807, 0, 0.001637075196610181, 0.007099480278225614, 0.4917979238213417, 1, 0.001111415271448382],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552695486627017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005552959073840321],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555470092064022],
[520.5124852305007, 1221.601299142638, 1, 0, 0.298782140351295, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987821403512949, 0.0005554578038841607],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 0, 0, 0.2985229969158424, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581519689230764e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.000479485508561275],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555860044177617],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555735002571021],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 2, 0.2988373348736033, 0, 0.001637435659033448, 0.007101043490392242, 0.4916290829671515, 1, 0.001111648074325117],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552695990625394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005555531818885505],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005552958656839391],
[520.5783340836466, 1221.540682663095, 0, 1, 0.2988190411099364, 0, 0.0008186383099577889, 0.003550176893877402, 0.7011809588900636, 1, 0.000555409401037276],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001118820790519829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004434498988285302],
[520.5732204402805, 1221.308389744603, 0, 1, 0.2988568324026492, 0, 0.0008187940150064123, 0.003550852137705059, 0.7011431675973508, 1, 0.0005554560026210783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.693120692678, 0, 1, 0.29871657737713, 0, 0.0008185361635113556, 0.003549733916863612, 0.7012834226228699, 1, 0.0005554278026900018],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005558645606916162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298844078689861, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701155921310139, 1, 0.0005554730865050015],
[520.3257041320941, 1221.640708755309, 0, 1, 0.2987001932314103, 0, 0.0008185712810920227, 0.003549886210766715, 0.7012998067685896, 1, 0.000555482475424546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005553508761483723],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005556543432220512],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175340027],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877824, 0, 0.0008185922196038122, 0.003549977014507321, 0.7012332935122176, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554053556110255],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554699035383493],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005556378828691517],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0005555776572943883],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552745588167536],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025988011194],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005554178542131598],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554094011571952],
[520.5124852305008, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009284, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.2987600194009283, 0.0005554853415448106],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552746100982557],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005556502322315769],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554094011571952],
[520.4588190077809, 1221.74254383717, 0, 1, 0.2987363172290778, 0, 0.0008185030512723775, 0.003549590319496747, 0.7012636827709222, 1, 0.0005554336317421413],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593221, 0.003549633547521259, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555776572943883],
[520.4258960540643, 1221.693120692678, 0, 1, 0.2987315396085367, 0, 0.0008185361635113556, 0.003549733916863612, 0.7012684603914634, 1, 0.0005552746100982557],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556024112614198],
[521.1965550027986, 1220.922461743943, 0, 1, 0.2991739083223421, 0, 0.0008190528320460403, 0.003551974545809655, 0.7008260916776579, 1, 0.0005551967958419893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005554673873781875],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005556667987501664],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555775321435316],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360654, 0.0005555496753329713],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593222, 0.00354963354752126, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552959182378329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618390708692],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593221, 0.003549633547521259, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552959182378329],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005555852571720137],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005553153991095415],
[520.7577138041534, 1220.950718027857, 0, 1, 0.2989924744501558, 0, 0.0008190338768261276, 0.003551892342982187, 0.7010075255498442, 1, 0.0005556364815663643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
],
"NAMES": [
["epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2"],
["epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6"],
["epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3"],
["epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1"],
["epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2"],
["epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3"],
["epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1"],
["epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21"],
["epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1"],
["epi_isl_413749_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4"],
["epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_420756_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1"],
["epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1"],
["Node1007"],
["epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6"],
["epi_isl_425435_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2"],
["epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_6"],
["epi_isl_433888_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_424144_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2"],
["epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33"],
["epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2"],
["epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10"],
["Node181"],
["epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3"],
["epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1"],
["epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2"],
["epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2"],
["epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2"],
["epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7"],
["epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_435668_California_20200320_null_1"],
["epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2"],
["epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_36"],
["Node165"],
["epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3"],
["epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2"],
["epi_isl_424148_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["epi_isl_425259_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_436605_Wisconsin_20200414_null_3"],
["epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3"],
["epi_isl_423147_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3"],
["epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4"],
["epi_isl_417231_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3"],
["epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1"],
["epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69"],
["Node143"],
["epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13"],
["epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2"],
["epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2"],
["epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2"],
["epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1"],
["epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15"],
["epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_432566_England_20200403_null_10"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2"],
["epi_isl_435059_EC_20200320_null_1"],
["epi_isl_435620_California_20200309_null_3"],
["epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5"],
["epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1"],
["epi_isl_423598_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1"],
["epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2"],
["epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1"],
["epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2"],
["epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1"],
["Node256"],
["epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1"],
["epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_421864_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_433696_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3"],
["epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1"],
["Node505"],
["epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1"],
["epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_4"],
["Node502"],
["epi_isl_406036_California_20200122_null_1"],
["epi_isl_424146_England_20200321_null_1"],
["Node499"],
["epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2"],
["epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8"],
["Node496"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424088_England_20200313_null_6"],
["Node464"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1"],
["Node461"],
["epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1"],
["epi_isl_421915_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1"],
["epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200401_null_1"],
["epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1"],
["epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1"],
["epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2"],
["epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1"],
["epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1"],
["epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1"],
["epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3"],
["epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1"],
["epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5"],
["epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2"],
["epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424026_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423967_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423814_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423593_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1"],
["epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1"],
["epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2"],
["epi_isl_420528_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_418732_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_420542_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8"],
["epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1"],
["Node364"],
["epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2"],
["epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_7"],
["epi_isl_434013_England_20200414_null_3"],
["Node376"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["Node375"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node380"],
["epi_isl_420634_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4"],
["epi_isl_433804_England_20200406_null_1"],
["Node398"],
["epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17"],
["epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2"],
["epi_isl_423385_England_20200328_null_1"],
["Node390"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3"],
["Node395"],
["epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2"],
["epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node407"],
["epi_isl_421880_England_20200326_null_2"],
["Node406"],
["epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2"],
["epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_423362_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_432619_England_20200330_null_10"],
["Node493"],
["epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1"],
["epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3"],
["Node490"],
["epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3"],
["epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1"],
["Node487"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_432548_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1"],
["epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1"],
["Node476"],
["epi_isl_432559_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4"],
["epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5"],
["epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_4"],
["Node528"],
["epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7"],
["epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1"],
["Node525"],
["epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1"],
["epi_isl_436073_New_York_20200317_null_2"],
["Node522"],
["epi_isl_423409_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9"],
["Node519"],
["epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1"],
["epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1"],
["Node514"],
["epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1"],
["Node513"],
["epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2"],
["epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2"],
["Node54"],
["epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4"],
["epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4"],
["Node532"],
["epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2"],
["Node535"],
["epi_isl_423404_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2"],
["Node540"],
["epi_isl_423112_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3"],
["Node543"],
["epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1"],
["epi_isl_417261_England_20200306_null_1"],
["Node556"],
["epi_isl_423282_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_1"],
["Node553"],
["epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3"],
["epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6"],
["Node549"],
["epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1"],
["epi_isl_423145_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4"],
["Node567"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_418731_England_20200313_null_2"],
["epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16"],
["Node562"],
["epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7"],
["epi_isl_423736_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423656_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_435594_California_20200304_null_12"],
["Node614"],
["epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1"],
["epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_432999_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_433922_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1"],
["epi_isl_433908_England_20200411_null_2"],
["Node594"],
["epi_isl_433904_England_20200410_null_1"],
["Node579"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_1"],
["Node578"],
["epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7"],
["epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1"],
["Node600"],
["epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1"],
["Node599"],
["epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1"],
["epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1"],
["epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2"],
["Node610"],
["epi_isl_433673_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_433866_England_20200408_null_3"],
["Node606"],
["epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_436621_Wisconsin_20200425_null_12"],
["Node618"],
["epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1"],
["epi_isl_423907_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["Node829"],
["epi_isl_415149_England_20200301_null_1"],
["Node828"],
["epi_isl_423779_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_429001_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_433895_England_20200410_null_49"],
["Node815"],
["epi_isl_423954_England_20200320_null_2"],
["Node814"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_434004_England_20200414_null_4"],
["Node810"],
["epi_isl_423709_England_20200323_null_1"],
["Node809"],
["epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2"],
["epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1"],
["Node805"],
["epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2"],
["Node804"],
["epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18"],
["epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1"],
["epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3"],
["Node792"],
["epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1"],
["Node791"],
["epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4"],
["epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2"],
["epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4"],
["epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1"],
["epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2"],
["epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2"],
["epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1"],
["Node782"],
["epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1"],
["epi_isl_416682_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1"],
["epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_417368_USA_20200313_null_2"],
["epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1"],
["Node767"],
["epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1"],
["epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9"],
["Node758"],
["epi_isl_429061_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1"],
["epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_429041_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9"],
["Node748"],
["epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1"],
["epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1"],
["epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_417324_California_20200304_null_1"],
["epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6"],
["Node763"],
["epi_isl_436503_Pennsylvania_20200301_null_1075"],
["Node689"],
["epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4"],
["Node688"],
["epi_isl_413931_California_20200305_null_2"],
["epi_isl_435631_California_20200311_null_6"],
["Node798"],
["epi_isl_435640_California_20200312_null_2"],
["Node797"],
["Node685"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7"],
["Node682"],
["epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_423121_England_20200324_null_1"],
["Node679"],
["epi_isl_433853_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2"],
["Node676"],
["epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2"],
["epi_isl_433741_England_20200326_null_18"],
["Node673"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_436554_Florida_20200417_null_6"],
["Node670"],
["epi_isl_423061_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8"],
["epi_isl_423091_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_436200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_493"],
["epi_isl_422003_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423062_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_423743_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425255_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7"],
["epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2"],
["Node651"],
["epi_isl_421939_England_20200401_null_2"],
["Node638"],
["epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2"],
["epi_isl_436365_Comunitat_Valenciana_20200321_null_19"],
["Node667"],
["epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1"],
["epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1"],
["epi_isl_433832_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18"],
["Node121"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6"],
["Node120"],
["epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4"],
["epi_isl_434007_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7"],
["epi_isl_436464_Alaska_20200407_null_7"],
["epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1"],
["epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node76"],
["epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1"],
["epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_432456_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_433900_England_20200410_null_2"],
["Node824"],
["epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11"],
["epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4"],
["epi_isl_433981_England_20200413_null_1"],
["Node834"],
["epi_isl_432466_England_20200401_null_7"],
["epi_isl_423870_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423888_England_20200318_null_2"],
["Node841"],
["epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9"],
["Node840"],
["epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1"],
["Node839"],
["epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1"],
["Node847"],
["epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5"],
["epi_isl_421931_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_429643_USA_20200408_null_1"],
["epi_isl_436244_Comunitat_Valenciana_20200319_null_3"],
["Node854"],
["epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1"],
["epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1"],
["Node857"],
["epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_423312_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4"],
["Node867"],
["epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1"],
["Node863"],
["epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_33"],
["epi_isl_423758_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1"],
["epi_isl_423570_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1"],
["Node873"],
["epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8"],
["Node878"],
["epi_isl_436643_California_20200422_null_12695"],
["epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1"],
["epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_436384_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["Node884"],
["epi_isl_435474_California_20200429_null_1"],
["epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1"],
["Node892"],
["epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3"],
["Node900"],
["epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5"],
["epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1"],
["Node903"],
["epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7"],
["epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1"],
["Node913"],
["epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3"],
["epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_432847_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1"],
["epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4"],
["epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_433771_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1"],
["Node932"],
["epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2"],
["epi_isl_433809_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_433902_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4"],
["epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1"],
["Node963"],
["epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2"],
["Node960"],
["epi_isl_423339_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12"],
["Node953"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_29"],
["Node956"],
["epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_433687_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15"],
["epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1"],
["epi_isl_436648_California_20200422_null_1"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5"],
["epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4"],
["epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1"],
["epi_isl_429011_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3"],
["epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1"],
["epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4"],
["epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1"],
["Node100"],
["epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1"],
["epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16"],
["epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1"],
["Node1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4"]
],
"RESOLVED": [
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555901282832061],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.0005554618392000862],
[520.2931259852755, 1221.908236859675, 1, 0, 0.2986412116769648, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986412116769648, 0.000555433631729556],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005559573461408557],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.00055540940114453],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.00055618526043223],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0005556026000850723],
[520.2931259852757, 1221.957022763958, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081597, 1, 0.2986328492259254, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556024104717835],
[520.3515580987508, 1221.767458647991, 1, 0, 0.2986888686115503, 0.001921777660575819, 0, -0.008334145327376429, 1, 0.2986888686115503, 0.0005552746100982557],
[520.4588190077809, 1221.660197738961, 0, 1, 0.2987504378315628, 0, 0.0008185582225325765, 0.003549829579901229, 0.7012495621684371, 1, 0.0005554094011571952],
[520.5018546535383, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2986961530502496, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7013038469497503, 1, 0.0005555862031590382],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555602599302923],
[520.3887270764076, 1221.975401261799, 1, 0, 0.2986681822775658, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986681822775659, 0.0005554094011571952],
[520.4206636804612, 1221.698353066281, 0, 1, 0.2987285361549535, 0, 0.000818532657828464, 0.003549718713819425, 0.7012714638450466, 1, 0.0005561858220865329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556025988044274],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554618390693882],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 1, 0, 0.2987034639457931, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987034639457931, 0.0005559567569260764],
[520.3887270764076, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986877214216319, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013122785783681, 1, 0.000555433631729556],
[520.0169298016, 1222.070150341088, 1, 0, 0.2985022595764887, 0.001923014314902259, 0, -0.008339508308270478, 1, 0.2985022595764888, 0.0005555776574806229],
[520.3865856016128, 1221.732431145129, 0, 1, 0.2987089748743976, 0, 0.0008185098262986279, 0.003549619700654893, 0.7012910251256024, 1, 0.0005557008672273207],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855174017367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.2683443811159, 1220.687603759081, 0, 1, 0.299243126634545, 0, 0.0008192104162609021, 0.003552657938990302, 0.700756873365455, 1, 0.0005551659200198466],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.0005553501853148444],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555774635455052],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618391986052],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555496723140319],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552959182378329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554094010246092],
[520.5018546535383, 1221.862273684668, 0, 1, 0.2987331099096783, 0, 0.0008184228464509206, 0.003549242496409982, 0.7012668900903217, 1, 0.0005553132697065267],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005553492965555406],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555735002557171],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005554395042848172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555101137701484],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 1, 0, 0.2989746461734846, 0.001919940712388245, 0, -0.008326179060795144, 1, 0.2989746461734846, 0.0005557088504503228],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005555776574806229],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553226989291138],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025992407542],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556543432654705],
[520.2256584698628, 1221.730289670334, 0, 1, 0.298644554717519, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7013554452824811, 1, 0.0005557004187918396],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013833994870571, 1, 0.0005556025987919047],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005555776574917911],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552745568188016],
[520.2597365487112, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986361617934989, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2986361617934989, 0.0005556024712497937],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005555735002557171],
[520.4280375288591, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987327688441826, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012672311558175, 1, 0.0005554174860284007],
[519.960442597654, 1222.240920247297, 0, 2, 0.2984502559156409, 0, 0.001636338603027084, 0.007096285903509602, 0.4921720434248296, 1, 0.001111192831949263],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556150504161874],
[520.3887270764076, 1221.732431145129, 1, 0, 0.2987098369252642, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987098369252642, 0.0005554094011571952],
[520.4206636804612, 1221.698353066281, 0, 1, 0.2987285361549535, 0, 0.000818532657828464, 0.003549718713819425, 0.7012714638450466, 1, 0.0005555707526764496],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553977329719376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553715227040915],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553449999921616],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005554094011571952],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175340027],
[520.428037528859, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987327688441825, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012672311558175, 1, 0.000555957346170339],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618391874846],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855175340027],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552745591787581],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005556541546165754],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554854006487144],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.000555274556795432],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555734417777794],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555860044177617],
[520.0625898633181, 1221.829485068772, 0, 1, 0.29856188988264, 0, 0.000818444809378384, 0.003549337742719193, 0.7014381101173599, 1, 0.0005553762790156145],
[520.2713185315807, 1221.866171105263, 0, 1, 0.2986396433269074, 0, 0.0008184202359047477, 0.00354923117529223, 0.7013603566730926, 1, 0.0005667452210951124],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005554596331842042],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005552858878987155],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556543445785046],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552746100982557],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025992407542],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618390567873],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005556025993049479],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877825, 0, 0.0008185922196038123, 0.003549977014507321, 0.7012332935122174, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618391874846],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556024112627105],
[520.3780964994451, 1222.201609794845, 0, 1, 0.2986251329679852, 0, 0.0008181956168163261, 0.003548257072946983, 0.7013748670320148, 1, 0.000555957348005022],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555735002557171],
[520.3908685512024, 1221.728148195539, 0, 1, 0.2987114333456894, 0, 0.0008185126957064661, 0.003549632144374278, 0.7012885666543105, 1, 0.0005554174860146608],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005554766281183761],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 2, 0.2986166005129429, 0, 0.001636804052049527, 0.007098304409539254, 0.4919386730760207, 1, 0.001111578198172207],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.0005554618391986052],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005556026000850723],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552746100982557],
[520.2931259852755, 1221.957022763957, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986328492259253, 0.000555409401030367],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554855175712375],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554094011502876],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986822463773925, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013177536226075, 1, 0.0005554855174497603],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554053558074996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.112530892732, 1221.843417247465, 1, 0, 0.2985796118713744, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985796118713744, 0.0005554828230661217],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554673873214233],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005555901283124398],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005556543427496656],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556025992407542],
[520.1235112041988, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985438550885164, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014561449114836, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618392015607],
[520.5124852305007, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009283, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987600194009283, 0.0005554855177202657],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005559567569260764],
[520.3887270764076, 1221.732431145129, 1, 0, 0.2987098369252642, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987098369252642, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554336315987333],
[520.2042337125346, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985763545901647, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014236454098353, 1, 0.0005553226993871776],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555733311365753],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555735002557171],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555860044177617],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938712231491e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.21393870733721e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938728508696e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632069671654999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1264630714253, 1221.992553675316, 0, 0, 0.2985596610056625, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938673014679e-05],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0004632069682482123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.636243384594, 1221.482773362148, 0, 0, 0.2988522818359663, 0, 0, 0, 1, 1, 9.17770004444551e-05],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0004634762362195322],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.252114424820738e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.000462798104752266],
[520.8887270764076, 1221.269600122786, 0, 2, 0.2989904642672874, 0, 0.001637640042623611, 0.007101929837745474, 0.4914143691881933, 1, 0.001112181234678041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555189491597179],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 1, 1, 0.2986166005129429, 0.001922242749312472, 0.0008184020260247633, -0.00478701006619029, 0.9108281258980934, 0.5080613269239793, 0.001111648058778775],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005555775403496881],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555433631729556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8887270764076, 1221.230289670334, 0, 1, 0.2989972109076237, 0, 0.0008188463784909442, 0.0035510792216695, 0.7010027890923762, 1, 0.0005552394118214587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.4017704001291, 1219.479372995425, 0, 1, 0.2986988342319251, 0, 0.0008200220701918763, 0.00355617782682907, 0.7013011657680749, 1, 0.0005563573276054347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0001973933391558065],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001819953934752114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001760029570302874],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554301656523966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.9633944648806, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2984660574085619, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.7015339425914381, 1, 0.0005555191180202036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005553894551468868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0625898633181, 1222.017116430972, 0, 1, 0.2985297331599037, 0, 0.0008183191434507919, 0.003548792769112341, 0.7014702668400963, 1, 0.0005556176298501161],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005552607160069428],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555705445778651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555595078526979],
[520.3186351450342, 1221.718035503499, 0, 1, 0.2986840885222742, 0, 0.0008185194708923787, 0.003549661526224829, 0.7013159114777258, 1, 0.0005556543431565573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005554435419429481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001057876766186888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000449545515748905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005556025987919047],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005552746100982557],
[520.4588190077809, 1221.660197738961, 0, 1, 0.2987504378315628, 0, 0.0008185582225325765, 0.003549829579901229, 0.7012495621684371, 1, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556803623052874],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 0, 0.2985681263841206, 0, 0, 0, 1, 1, 7.838792467668707e-05],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0004769308816165886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.845437245776999e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004768913566201378],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 0, 0.2985681263841206, 0, 0, 0, 1, 1, 8.2113119399976e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0004731988613756392],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553769327911654],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005553986181400587],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005554995256854142],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005558772098246158],
[519.1763428222483, 1219.849083183832, 0, 2, 0.298544423248952, 0, 0.00163954707805326, 0.007110200050653656, 0.4920399261551454, 1, 0.001162305765458296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555331499809871],
[520.3887270764076, 1221.48517807887, 1, 0, 0.2987522377689091, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987522377689091, 0.0005553271991007588],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556323844420768],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552959182378329],
[519.6936031355721, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938981536108e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632069645743729],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213939166568673e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004632069645763206],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.404152457245, 0, 0, 0.2987661352799516, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213939277052931e-05],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0004632069634916608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213875773749451e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004632075949190324],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5586681047466, 1222.481727737092, 0, 0, 0.2986498014312122, 0, 0, 0, 1, 1, 8.048275344738785e-05],
[520.4736975905771, 1222.106008703713, 0, 1, 0.2986799947862347, 0, 0.0008182596214060833, 0.003548534640723734, 0.7013200052137653, 1, 0.0002510115303943005],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002237795207283645],
[520.3499394364839, 1222.014188901722, 1, 1, 0.2986459207770604, 0.001921783638685451, 0.0008183211038643861, -0.004785369981748263, 0.9108106140032217, 0.5081024555573426, 0.001111574034604539],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.000555457803880097],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 1, 0, 0.2985229969158424, 0.001922845479546641, 0, -0.00833877612243078, 1, 0.2985229969158424, 0.0005552665517173837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247633, 0.003549152204769626, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555101137588717],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.00055541521525467],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3101061715045, 1220.808910575237, 0, 0, 0.2992390882369256, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938716170292e-05],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0004632069671674485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.127337239775637e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004639559922145829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.285582017924411e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004624746017678244],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 9.213938768975218e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0004632069671674485],
[519.6936031355722, 1222.42541361117, 0, 0, 0.2983111935176825, 0, 0, 0, 1, 1, 9.214002526585796e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0004632063345554032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3887270764076, 1220.730289670334, 0, 0, 0.2992842177052039, 0, 0, 0, 1, 1, 9.1273374445242e-05],
[520.8887270764076, 1221.230289670334, 0, 1, 0.2989972109076237, 0, 0.0008188463784909442, 0.0035510792216695, 0.7010027890923762, 1, 0.0004639559922124692],
[520.5665116218895, 1221.488631916745, 0, 1, 0.2988232109372057, 0, 0.0008186731942243393, 0.003550328175970557, 0.7011767890627943, 1, 0.0005553297054365637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877824, 0, 0.0008185922196038122, 0.003549977014507321, 0.7012332935122176, 1, 0.0005555409291510383],
[520.5666742657486, 1221.552342480994, 0, 2, 0.2988123482159458, 0, 0.00163726099197515, 0.007100286014292056, 0.4916641230144362, 1, 0.001111530300891085],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7148642894971, 1221.404152457245, 0, 0, 0.2988974113042446, 0, 0, 0, 1, 1, 9.127337436547862e-05],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0004639559922145829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.651668765431, 1, 0, 0.2987236853511255, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987236853511255, 0.000555590126588173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005554348051913349],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552787805913678],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005553246961714765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005553611561284307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.7164899496048, 1219.409764146369, 0, 1, 0.2988377000954206, 0, 0.0008200688803734783, 0.003556380827865181, 0.7011622999045795, 1, 0.0005562888386168968],
[520.5411651059899, 1221.577851640752, 0, 1, 0.2987977056114432, 0, 0.0008186134012309231, 0.003550068872562617, 0.7012022943885567, 1, 0.0005556110053317355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5177176041038, 1221.601299142638, 1, 0, 0.2987842464265881, 0.001921164191303439, 0, -0.008331484904074199, 1, 0.2987842464265881, 0.0005555659344509957],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005556822944319406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.000555802808071971],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554768958389287],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005555792729203302],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000274149647016208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0002812966606447634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.977805978521, 0, 1, 0.2985681263841206, 0, 0.0008183454683935376, 0.003548906932110006, 0.7014318736158794, 1, 0.0005556483494881582],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0003186747082174198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002366842773700248],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618393341495],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005559573461408557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554336316113185],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.5305345290274, 1222.588482217714, 0, 2, 0.298217589920582, 0, 0.001635873418643778, 0.007094268545136656, 0.4924985510968764, 1, 0.001111530824568323],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005554789486818578],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.00055521546289574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552819257250268],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005555474211859809],
[519.1288774150106, 1219.997382362487, 1, 0, 0.2984998211006414, 0.00192630393627778, 0, -0.008353774361611641, 1, 0.2984998211006413, 0.0005567255410983363],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005554946737082099],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554187591706149],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005553717158904792],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552256445258485],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001402911907074352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004149784183046178],
[520.1412107682211, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986105522923269, 0.001922554835682127, 0, -0.008337515691395984, 1, 0.2986105522923268, 0.0005555973887458151],
[520.0280831910903, 1221.598305656001, 0, 1, 0.2985876227652561, 0, 0.0008185996946541263, 0.003550009431449678, 0.7014123772347439, 1, 0.0005558470542497018],
[520.0174526141278, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2985607157624773, 0.001923012381551811, 0, -0.008339499923937609, 1, 0.2985607157624772, 0.0005554644541540603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1412107682211, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2986105522923269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001588742361793284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0003965721262535662],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005553659638966199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001764029564083005],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003789922321996802],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555787775782344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003166756665944955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000238706889437675],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552430157340665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552161350462654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553895570536849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005553684831416423],
[520.2649689223143, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986154240543165, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986154240543164, 0.0005552353481373434],
[520.3887270764076, 1221.953243222865, 0, 1, 0.2986719805567349, 0, 0.0008183619181389706, 0.003548978269482612, 0.7013280194432651, 1, 0.0005555186061767025],
[520.2597365487112, 1222.121544203013, 1, 0, 0.2985912109456623, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2985912109456623, 0.0005552546062128689],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554556134903032],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.0005553747991628765],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552117849055502],
[521.3101061715045, 1221.07117458022, 0, 0, 0.2991940466363327, 0, 0, 0, 1, 1, 8.06444577776325e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.849416623956, 1221.531864127768, 0, 1, 0.2989296443768286, 0, 0.0008186442199066561, 0.003550202523466999, 0.7010703556231714, 1, 0.0004745834763497002],
[520.112530892732, 1222.105681252447, 1, 0, 0.2985346653289324, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985346653289325, 0.0005554496924000088],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554618102613063],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554819669096104],
[520.0411651059899, 1222.340115645734, 0, 1, 0.2984657668507699, 0, 0.0008181029054026612, 0.003547855012703054, 0.7015342331492301, 1, 0.0005555227580253764],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552822945524],
[520.2256584698628, 1222.123685677808, 0, 1, 0.2985771253148713, 0, 0.0008182477859803408, 0.003548483314204454, 0.7014228746851288, 1, 0.0005552006282204217],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005552693013038378],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553415173501674],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005555296518076105],
[520.2575950739164, 1222.123685677808, 0, 1, 0.2985899818950415, 0, 0.0008182477859803408, 0.003548483314204454, 0.7014100181049585, 1, 0.0005554739103041332],
[520.2649689223143, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986154240543165, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986154240543164, 0.0005555061359821627],
[520.5732204402805, 1221.68430215735, 0, 1, 0.298792350549951, 0, 0.0008185420719854697, 0.003549759540057668, 0.701207649450049, 1, 0.0005552296700042045],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554618102668969],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005554936682909325],
[520.2256584698629, 1222.155622281861, 0, 1, 0.298571652609479, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.701428347390521, 1, 0.0005550903996224672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424907, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005553712793402099],
[520.0169298016, 1222.33241434607, 1, 0, 0.2984573280601107, 0.001923014314902259, 0, -0.008339508308270478, 1, 0.2984573280601107, 0.0005552214348395948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1222.370897124656, 0, 1, 0.2986004035496119, 0, 0.0008180823041126617, 0.003547765671387298, 0.7013995964503881, 1, 0.0005555221715379196],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005554644032464625],
[520.4776193491485, 1221.871724798522, 0, 1, 0.2987217351660083, 0, 0.0008184165159930295, 0.003549215043204996, 0.7012782648339917, 1, 0.0005554769844063478],
[520.5732204402805, 1221.644991704899, 0, 1, 0.29879909233603, 0, 0.0008185684112734123, 0.003549873765265941, 0.70120090766397, 1, 0.0005551632507060876],
[520.349416623956, 1222.031864127768, 0, 1, 0.2986426807796392, 0, 0.0008183092678305532, 0.003548749941653184, 0.7013573192203608, 1, 0.0005552349215777377],
[520.9600928631497, 1221.297429734481, 1, 0, 0.2990144029261649, 0.001919532827368964, 0, -0.008324410191743702, 1, 0.2990144029261649, 0.0005554015087588116],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7362890468253, 1221.644991704899, 0, 1, 0.2988647173838791, 0, 0.0008185684112734123, 0.003549873765265941, 0.7011352826161209, 1, 0.0005552677729909946],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553213233001295],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553212298479675],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005551514477548913],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.000555325291406555],
[520.2931259852755, 1222.088154766449, 1, 0, 0.2986103740513115, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986103740513115, 0.0005551554843117387],
[520.4588190077809, 1222.004807842152, 0, 1, 0.2986913534308195, 0, 0.0008183273859337968, 0.003548828514168926, 0.7013086465691805, 1, 0.0005551595187699849],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.000555449692372271],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005554618102645038],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553698356948083],
[519.5804755584413, 1222.800805193283, 0, 2, 0.2982013645912657, 0, 0.001635589371143625, 0.007093036720459581, 0.4925213246615616, 1, 0.001111446358809112],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005553940304522529],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005553344460521285],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 1, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0.0008182527230187122, -0.004787027678266735, 0.9108414953972752, 0.5080299232916036, 0.001111359901358742],
[520.303756562238, 1221.616834641937, 0, 2, 0.2986954509806651, 0, 0.001637174556935613, 0.007099911172708838, 0.4918280704752125, 1, 0.00111138439654859],
[520.2649689223143, 1222.11631182941, 1, 0, 0.2985942139471643, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2985942139471642, 0.0005553030658857172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 2, 0.2986652421173245, 0, 0.001636671184275809, 0.007097728203790686, 0.4918704426143511, 1, 0.00111107770685395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 0, 0.2986652421173245, 0, 0, 0, 1, 1, 7.412131609356205e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0004810424629815433],
[520.2256584698628, 1222.155622281861, 0, 1, 0.2985716526094789, 0, 0.0008182264040424908, 0.003548390587464478, 0.7014283473905211, 1, 0.0005551542812476962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 0, 1, 0.2986652421173245, 0, 0.0008183355921379044, 0.003548864101895343, 0.7013347578826755, 1, 0.0005552259629362498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2986652421173245, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2986652421173245, 0.0005549799814143922],
[520.3887270764076, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986877214216319, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013122785783681, 1, 0.0005552012975161785],
[520.463065031721, 1221.655951715021, 0, 0, 0.2987528751070298, 0, 0, 0, 1, 1, 7.271047767915134e-07],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4258960540643, 1221.693120692678, 1, 0, 0.2987315396085367, 0.001921503152671933, 0, -0.008332954872928218, 1, 0.2987315396085366, 0.0005545818026755786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6509910813897, 1221.468025665352, 1, 0, 0.2988607472144245, 0.001920672421890535, 0, -0.008329352254788707, 1, 0.2988607472144245, 0.0005553212124155475],
[520.5198590788987, 1221.599157667843, 0, 1, 0.298785475662234, 0, 0.0008185991237167365, 0.003550006955473775, 0.701214524337766, 1, 0.0005554585418136157],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555367877880637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552503723296946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552230866775041],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555303117605053],
[520.0625898633181, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985339423911206, 0.001922845479546641, 0, -0.00833877612243078, 1, 0.2985339423911206, 0.0005552614497476221],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.861421672825, 0, 1, 0.2986220748662305, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.7013779251337695, 1, 0.0005552467819008582],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005556213813739458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759044, 0, 0.0008184849253897802, 0.003549511713244395, 0.7013123606240956, 1, 0.0005552844444071551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552150668020542],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005553617865854827],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555021417598204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7600015386872, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2988808563865306, 0.001920270368394855, 0, -0.008327608675221145, 1, 0.2988808563865306, 0.0005550857162922876],
[520.5124852305007, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009283, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987600194009283, 0.0005551777885190134],
[519.7164879845194, 1219.898177344066, 0, 1, 0.29875379780519, 0, 0.000819740547671919, 0.003554956952197012, 0.70124620219481, 1, 0.0005556164009611207],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555377851797115],
[520.7577138041534, 1221.113786634402, 1, 0, 0.2989644837021794, 0.001920278804311827, 0, -0.008327645259140011, 1, 0.2989644837021794, 0.000555435640936573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005554649229529651],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555776574917911],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005556803618233823],
[520.5411651059899, 1221.822963232217, 0, 1, 0.298755671469465, 0, 0.0008184491780663501, 0.003549356688344979, 0.701244328530535, 1, 0.0005555862028041344],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556499943930002],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553867525559949],
[520.0027049173322, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985098279414609, 0.001923066919736458, 0, -0.008339736438892518, 1, 0.2985098279414609, 0.0005555130033778827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1264630714253, 1221.992553675316, 1, 0, 0.2985596610056625, 0.001922609347916753, 0, -0.008337752093813811, 1, 0.2985596610056624, 0.0005554476647414843],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005553446407839529],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005555409083694843],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000555409401037276],
[520.3887270764076, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2987034639457932, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7012965360542068, 1, 0.00055532269947242],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.000818717829516724, 0.003550521745196121, 0.7011626651263967, 1, 0.0005556025988031366],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005555776572943883],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005559573461408557],
[520.7362890468253, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298909709406224, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701090290593776, 1, 0.0005554336315959765],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554578040130566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8386224435903, 1221.280394303152, 1, 0, 0.2989684501672061, 0.001919980502421948, 0, -0.008326351617657608, 1, 0.2989684501672061, 0.0005552905785617186],
[520.5517956829523, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554898532779007],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556667897517332],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.298781242973005, 0.0005554618390582678],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556024112627105],
[519.9280375288591, 1222.190979217883, 1, 0, 0.2984457620466024, 0.001923343093311243, 0, -0.008340934116831575, 1, 0.2984457620466023, 0.0005552740471435397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1307460210149, 1221.988270725727, 1, 0, 0.2985621194769544, 0.001922593516437878, 0, -0.00833768343766883, 1, 0.2985621194769543, 0.0005556269684441971],
[520.2597365487112, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986361617934989, 0.001922116838473376, 0, -0.008335616235248892, 1, 0.2986361617934989, 0.0005555864067407712],
[520.0433065807847, 1222.075710165957, 1, 0, 0.2985119280495089, 0.001922916778940712, 0, -0.008339085325479674, 1, 0.298511928049509, 0.0005557971161970443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1264630714253, 1220.992553675316, 1, 0, 0.2991336746008229, 0.001918920014359241, 0, -0.008321752614446227, 1, 0.2991336746008229, 0.0005553985064105052],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005555508069279954],
[520.5411651059899, 1221.577851640752, 0, 1, 0.2987977056114432, 0, 0.0008186134012309231, 0.003550068872562617, 0.7012022943885567, 1, 0.0005553876634978208],
[519.3887270764075, 1222.690979217883, 0, 1, 0.2981429180305639, 0, 0.0008178681424800146, 0.003546836919738944, 0.7018570819694361, 1, 0.0005556182642458993],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.3887270764075, 1222.730289670334, 1, 0, 0.2981361905148832, 0.00192534020834243, 0, -0.008349594976642182, 1, 0.2981361905148832, 0.0005553469329656031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.3887270764075, 1222.730289670334, 0, 0, 0.2981361905148832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001720310692428251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.000383342772630941],
[520.7577138041535, 1221.07447618195, 0, 1, 0.2989712308671411, 0, 0.0008189508662295482, 0.003551532352131113, 0.7010287691328589, 1, 0.0005555998767471024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.000818717829516724, 0.003550521745196121, 0.7011626651263967, 1, 0.0005555019404593493],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005553048710789017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005554815701922888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553490116627893],
[520.3887270764076, 1221.404152457245, 0, 1, 0.2987661352799516, 0, 0.0008187298184537694, 0.003550573737445644, 0.7012338647200484, 1, 0.0005552990958882642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.56722106379, 0, 1, 0.2987381670770731, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.7012618329229269, 1, 0.0005558790718264308],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554618391986052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7577138041535, 1221.035165729499, 0, 0, 0.2989779783366557, 0, 0, 0, 1, 1, 7.587407110075193e-05],
[520.5732204402805, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298844078689861, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701155921310139, 1, 0.0004794276741451905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553537602853968],
[520.112530892732, 1221.843417247465, 1, 0, 0.2985796118713744, 0.001922660848573633, 0, -0.00833797543596608, 1, 0.2985796118713744, 0.0005555971445826407],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554855175712375],
[520.349416623956, 1221.769600122786, 0, 1, 0.2986876393759045, 0, 0.0008184849253897803, 0.003549511713244395, 0.7013123606240955, 1, 0.0005561858242558915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 0, 0, 0.2985229969158424, 0, 0, 0, 1, 1, 7.590028863961505e-05],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0004794029372801319],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554174859159596],
[519.8566717421169, 1222.294281608679, 1, 2, 0.2983993268449222, 0.001923607129343655, 0.001636267165847959, -0.00124610305513627, 0.7860137653875947, 0.6546416258363099, 0.001670189162536517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005553965154893533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.00055540535580907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581598607786567e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.000479484727552507],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554699035383493],
[520.2649689223143, 1221.854047824427, 1, 0, 0.2986391652470821, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986391652470821, 0.0005555734417777794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581598723176314e-05],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004794847274531345],
[520.2931259852755, 1221.825890761466, 1, 0, 0.2986553277840215, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986553277840216, 0.0005554174859159596],
[520.2931259852755, 1221.957022763957, 1, 0, 0.2986328492259253, 0.001921993488009873, 0, -0.008335081303081599, 1, 0.2986328492259253, 0.0005554094011571952],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005556707755684321],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002093167902014573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0003460066739106921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4062300751643, 1221.742320306959, 0, 2, 0.2987151870378782, 0, 0.001637006402051708, 0.007099181937860958, 0.4918003888913181, 1, 0.001113602444671284],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005553112836794161],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.000555409401030367],
[520.5124852305008, 1221.606531516241, 1, 0, 0.298781242973005, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.298781242973005, 0.0005554578038856568],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3101061715045, 1220.808910575237, 0, 0, 0.2992390882369256, 0, 0, 0, 1, 1, 7.723763124581473e-05],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 1, 0, 0.2989746461734846, 0.001919940712388245, 0, -0.008326179060795144, 1, 0.2989746461734846, 0.000478688899644126],
[520.3186351450341, 1221.800381601708, 0, 1, 0.2986699703885241, 0, 0.000818464304855642, 0.003549422288472861, 0.7013300296114759, 1, 0.0005556624627871544],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554578040316878],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175712375],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 2, 0.2987169445784807, 0, 0.001637075196610181, 0.007099480278225614, 0.4917979238213417, 1, 0.001111415271448382],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552695486627017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.690979217883, 0, 1, 0.2987169445784807, 0, 0.0008185375983050904, 0.003549740139112807, 0.7012830554215193, 1, 0.0005552959073840321],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005555470092064022],
[520.5124852305007, 1221.601299142638, 1, 0, 0.298782140351295, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987821403512949, 0.0005554578038841607],
[520.0625898633181, 1222.056426883424, 0, 0, 0.2985229969158424, 0, 0, 0, 1, 1, 7.581519689230764e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.000479485508561275],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555860044177617],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005555735002571021],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 2, 0.2988373348736033, 0, 0.001637435659033448, 0.007101043490392242, 0.4916290829671515, 1, 0.001111648074325117],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005552695990625394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005555531818885505],
[520.4736975905771, 1221.890430747629, 0, 1, 0.2987169496464456, 0, 0.0008184039868354948, 0.003549160708189106, 0.7012830503535543, 1, 0.0005552958656839391],
[520.5783340836466, 1221.540682663095, 0, 1, 0.2988190411099364, 0, 0.0008186383099577889, 0.003550176893877402, 0.7011809588900636, 1, 0.000555409401037276],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 0, 0.2987102041100435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001118820790519829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0004434498988285302],
[520.5732204402805, 1221.308389744603, 0, 1, 0.2988568324026492, 0, 0.0008187940150064123, 0.003550852137705059, 0.7011431675973508, 1, 0.0005554560026210783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3887270764076, 1221.693120692678, 0, 1, 0.29871657737713, 0, 0.0008185361635113556, 0.003549733916863612, 0.7012834226228699, 1, 0.0005554278026900018],
[520.0411651059898, 1222.077851640752, 0, 1, 0.298510698813863, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005558645606916162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5732204402805, 1221.382727699917, 0, 1, 0.298844078689861, 0, 0.0008187441801172184, 0.003550636019463373, 0.701155921310139, 1, 0.0005554730865050015],
[520.3257041320941, 1221.640708755309, 0, 1, 0.2987001932314103, 0, 0.0008185712810920227, 0.003549886210766715, 0.7012998067685896, 1, 0.000555482475424546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2649689223143, 1221.859280198031, 1, 0, 0.2986382683009051, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.298638268300905, 0.0005553508761483723],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005556543432220512],
[520.5124852305007, 1221.606531516241, 1, 0, 0.2987812429730049, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075231, 1, 0.2987812429730049, 0.0005554855175340027],
[520.4776193491485, 1221.60946079354, 0, 1, 0.2987667064877824, 0, 0.0008185922196038122, 0.003549977014507321, 0.7012332935122176, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554053556110255],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 0, 1, 0.2987102041100435, 0, 0.0008185112610000323, 0.00354962592250368, 0.7012897958899564, 1, 0.0005554699035383493],
[520.2575950739164, 1221.861421672825, 0, 1, 0.298634932557853, 0, 0.0008184234171424452, 0.003549244971319645, 0.701365067442147, 1, 0.0005556378828691517],
[520.849416623956, 1221.269600122786, 0, 1, 0.2989746461734846, 0, 0.0008188200213118058, 0.003550964918872738, 0.7010253538265154, 1, 0.0005555776572943883],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005552745588167536],
[520.2649689223143, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2986603817410126, 0.00192209750749011, 0, -0.008335532402853939, 1, 0.2986603817410125, 0.0005556025988011194],
[520.2256584698628, 1221.893358276879, 0, 1, 0.2986166005129429, 0, 0.0008184020260247635, 0.003549152204769627, 0.7013833994870571, 1, 0.0005554178542131598],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5517956829524, 1221.56722106379, 0, 1, 0.298803807707144, 0, 0.0008186205251391404, 0.003550099766712133, 0.701196192292856, 1, 0.0005554094011571952],
[520.5124852305008, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987600194009284, 0.00192118350351801, 0, -0.008331568655075229, 1, 0.2987600194009283, 0.0005554853415448106],
[520.1367661971218, 1222.014187153674, 0, 1, 0.2985601019226881, 0, 0.000818321105034966, 0.003548801275885998, 0.7014398980773119, 1, 0.0005552746100982557],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005556502322315769],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554094011571952],
[520.4588190077809, 1221.74254383717, 0, 1, 0.2987363172290778, 0, 0.0008185030512723775, 0.003549590319496747, 0.7012636827709222, 1, 0.0005554336317421413],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593221, 0.003549633547521259, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552746100982557],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555776572943883],
[520.4258960540643, 1221.693120692678, 0, 1, 0.2987315396085367, 0, 0.0008185361635113556, 0.003549733916863612, 0.7012684603914634, 1, 0.0005552746100982557],
[520.0411651059899, 1222.077851640752, 0, 1, 0.2985106988138631, 0, 0.0008182784743683948, 0.003548616400092146, 0.7014893011861369, 1, 0.0005556024112614198],
[521.1965550027986, 1220.922461743943, 0, 1, 0.2991739083223421, 0, 0.0008190528320460403, 0.003551974545809655, 0.7008260916776579, 1, 0.0005551967958419893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7575950739165, 1221.361421672825, 0, 1, 0.2989219393554332, 0, 0.0008187584626918705, 0.003550697958497863, 0.7010780606445668, 1, 0.0005554673873781875],
[519.8887270764075, 1222.230289670334, 0, 1, 0.2984231973124633, 0, 0.0008181764176943485, 0.003548173812392966, 0.7015768026875366, 1, 0.0005556667987501664],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005555775321435316],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360654, 0.0005555496753329713],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593222, 0.00354963354752126, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552959182378329],
[520.3887270764076, 1221.730289670334, 1, 0, 0.2987102041100435, 0.001921640396820456, 0, -0.008333550057637975, 1, 0.2987102041100436, 0.0005554618390708692],
[520.4736975905771, 1221.727665254374, 0, 1, 0.2987448573342077, 0, 0.0008185130192593221, 0.003549633547521259, 0.7012551426657923, 1, 0.0005552959182378329],
[520.4843281675395, 1221.634688579202, 1, 0, 0.2987650804360654, 0.001921287435340625, 0, -0.008332019374704028, 1, 0.2987650804360653, 0.0005555852571720137],
[520.5732204402805, 1221.422038152368, 0, 1, 0.2988373348736033, 0, 0.0008187178295167238, 0.00355052174519612, 0.7011626651263967, 1, 0.0005553153991095415],
[520.7577138041534, 1220.950718027857, 0, 1, 0.2989924744501558, 0, 0.0008190338768261276, 0.003551892342982187, 0.7010075255498442, 1, 0.0005556364815663643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989918890865581, 0, -8.673371013043496, 1, 0.1111111111111109, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.009538893246058, 1, 0, 0.3333989348192665, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333989348192665, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.273724839104528, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.9989040583873496, 2.000547970806325, 0, 2, 0.3330288494915117, 0, 0.9997260896442767, 4.335497643451997, 0.4448505156106166, 1, 0.2305908506614428],
[0.920484783070691, 2.005215072252849, 1, 0, 0.3146203741288762, 1.086384064562208, 0, -4.711306027303118, 1, 0.3146203741288762, 0.2305908506614428],
[0.6741608496886017, 2.325839150311396, 1, 0, 0.2247202832295341, 1.483325530490098, 0, -6.43271632953009, 1, 0.2247202832295341, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.505028259782623, 0.2962962962962963, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809186920152, 2.004593732601037, 1, 0, 0.3148268445655527, 1.085680942582172, 0, -4.708256808402975, 1, 0.3148268445655527, 0.2305908506614428],
[0.3057132823599206, 2.69428671764008, 0, 1, 0.1019044274533068, 0, 0.371155747253172, 1.609585749775081, 0.8980955725466931, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999810529181635, 0, 1, 0.3333543869761686, 0, 0.5000473721924151, 2.168548191561133, 0.6666456130238314, 1, 0.2305908506614428],
[0.921080988440667, 2.078919011559333, 1, 0, 0.3070269961468891, 1.085680860369226, 0, -4.708256451871283, 1, 0.307026996146889, 0.2305908506614428],
[1.368756459525656, 1.305422176633668, 1, 0, 0.511841819771425, 0.7305901594404537, 0, -3.168339755652829, 1, 0.511841819771425, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809164608258, 2.004593734926559, 1, 0, 0.3148268437927778, 1.085680945212082, 0, -4.708256819808068, 1, 0.3148268437927778, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207827628243315, 2, 2, 0, 0.3152520531632949, 2.17206498725646, 0, -9.419562749458439, 1, 0.09938385702367292, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6734532524326465, 2.32432635081991, 0, 1, 0.2246506886970468, 0, 0.4302321830354194, 1.865781672608915, 0.7753493113029533, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000889418171132, 1.919987748696072, 0, 2, 0.3426674115312555, 0, 1.041673313466853, 4.517409561042186, 0.4320861318630198, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927667776099, 2.140015036804451, 0, 1, 0.2452265556138891, 0, 0.4672864362174001, 2.026474315338199, 0.7547734443861109, 1, 0.2305908506614428],
[1.368542419775476, 1.305713078721382, 0, 1, 0.5117470714913758, 0, 0.7658650405640794, 3.321315821365935, 0.4882529285086242, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.177177810745453, 1.759025886129838, 0, 1, 0.4009183054970628, 0, 0.5684964660754217, 2.465390384938114, 0.5990816945029371, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001293589543713, 1.998437812864874, 2, 2, 0.3337944153065638, 1.997416163336665, 1.000781704151648, -4.322090214447806, 0.8884786130529814, 0.4082271083011879, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9984206292315037, 2.001579370768496, 0, 1, 0.3328068764105012, 0, 0.4996054688633482, 2.166631795798685, 0.6671931235894988, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030741314, 2.00459374887923, 1, 0, 0.3148268391562817, 1.085680960991021, 0, -4.708256888236363, 1, 0.3148268391562817, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.324958718260123, 0, 1, 0.2247092018476538, 0, 0.4301151638289506, 1.865274197112238, 0.7752907981523462, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001109969536228, 1.998511223320606, 0, 5, 0.3337454649007772, 0, 2.501862357166202, 10.849790223635, 0.1312807022303867, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992146971984904, 2.000631503090054, 0, 2, 0.3330886420451754, 0, 0.999684348122541, 4.335316623599666, 0.4447707593691482, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6738884358005753, 2.325520172001505, 0, 1, 0.2246737687048216, 0, 0.4300113204949456, 1.864823861230709, 0.7753262312951784, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999051830706382, 2.000094816929362, 0, 1, 0.3333017276902128, 0, 0.4999762968913876, 2.168239960333295, 0.6666982723097872, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.6953965107178054, 1.384334380794986, 0, 1, 0.3343685058272013, 0, 0.7223688249552298, 3.132686413546491, 0.6656314941727988, 1, 0.2305908506614428],
[1.001264976951781, 1.998735023048219, 1, 0, 0.3337549923172602, 0.9987366211932911, 0, -4.331206629961447, 1, 0.3337549923172602, 0.2305908506614428],
[0.9207827922478655, 2, 2, 0, 0.3152520600613445, 2.172064917848313, 0, -9.41956244845713, 1, 0.09938386137292154, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.00140183953363388, 2.998598160466362, 0, 1, 0.0004672798445446272, 0, 0.3334891660990258, 1.446237633203669, 0.9995327201554554, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6948936726151935, 2.140414130966867, 1, 0, 0.2450857969414401, 1.439069082664915, 0, -6.240790033676483, 0.9999999999999999, 0.2450857969414402, 0.2305908506614428],
[1.000888765453543, 1.919988815536508, 0, 3, 0.3426671394815132, 0, 1.562509101992712, 6.776110576420107, 0.2840246481458745, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001664753009622, 1.998335246990378, 1, 2, 0.3338882510032075, 0.9983380137869279, 1.00083306993265, 0.01082027382511103, 0.740000542922377, 0.7044429782338397, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 2.168342753260875, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6743199789490487, 2.325680021050949, 0, 1, 0.2247733263163498, 0, 0.4299817648810137, 1.864695687828134, 0.7752266736836502, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996073224212553, 2.000315772596119, 0, 1, 0.3332109826686961, 0, 0.4999210693130443, 2.168000455694734, 0.6667890173313039, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609160005722, 2, 1, 0, 0.2521018507027002, 1.483325384586892, 0, -6.432715696793773, 1, 0.2521018507027002, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741607015216219, 2.325839298478376, 1, 0, 0.2247202338405408, 1.483325856495253, 0, -6.432717743311921, 1, 0.2247202338405409, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9995536891838138, 2.000446310816186, 0, 1, 0.3331845630612713, 0, 0.4998884471895664, 2.167858983804655, 0.6668154369387287, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9212650510544361, 2.078734948945563, 1, 2, 0.3070883503514787, 1.085463948573158, 0.9621236228382548, -0.5348882029842246, 0.775009097208516, 0.6673147172763054, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033868524, 2.325839096613145, 1, 0, 0.224720301128951, 1.483325412340282, 0, -6.432715817151498, 1, 0.224720301128951, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809097677342, 2.078919090232266, 1, 0, 0.3070269699225781, 1.08568095310125, 0, -4.708256854020909, 1, 0.3070269699225781, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625588427583, 2.000837441157242, 0, 1, 0.3330541862809194, 0, 0.4997907273374599, 2.167435203538326, 0.6669458137190806, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742555598103698, 2.325744440189628, 0, 1, 0.2247518532701235, 0, 0.4299698551223736, 1.864644038950453, 0.7752481467298765, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809906076789, 2, 1, 0, 0.3153219625095244, 1.085680857814962, 0, -4.708256440794246, 1, 0.3153219625095244, 0.2305908506614428],
[0.7386834704075685, 2.261316529592429, 0, 1, 0.2462278234691897, 0, 0.442220267226471, 1.917770223571211, 0.7537721765308103, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207826280231819, 2.079217371976818, 1, 2, 0.306927542674394, 1.086032652621704, 0.961900389519398, -0.5383225862875152, 0.7752143721305448, 0.6670830394102417, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.999050906840436, 2.000949093159564, 0, 1, 0.333016968946812, 0, 0.4997628392539299, 2.167314261690676, 0.666983031053188, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8351389007175476, 2.000168902864518, 0, 1, 0.2945496427803894, 0, 0.4999577778495916, 2.168159649073144, 0.7054503572196107, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.5040905085577506, 2.331415547557415, 0, 1, 0.1777779692872138, 0, 0.4289239646907577, 1.860108341074255, 0.8222220307127862, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999016391870131, 2.000098360812987, 0, 0.75, 0.3333005463956711, 0, 0.3749815582545376, 1.626177088895394, 0.7378151598329228, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.001110231642532, 1.998889768357468, 1, 0, 0.3337034105475105, 0.9988909996047988, 0, -4.331876120581152, 1, 0.3337034105475105, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996317889384981, 2.000368211061502, 0, 1, 0.3332105963128327, 0, 0.4999079641789282, 2.167943622849551, 0.6667894036871673, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609012211053, 2.325839098778892, 1, 0, 0.2247203004070353, 1.483325417105477, 0, -6.432715837816648, 1, 0.2247203004070353, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920483299542142, 1.079439753503469, 1, 0, 0.6401775197508517, 0.520702262934756, 0, -2.258121956882233, 1, 0.6401775197508517, 0.2305908506614428],
[0.9996071900375542, 2.000392809962446, 0, 1, 0.3332023966791847, 0, 0.4999018167930595, 2.167916963570352, 0.6667976033208153, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988980296933084, 2.001101970306691, 1, 2, 0.3329660098977695, 1.00110318598489, 0.9994493182641151, -0.007172304174386808, 0.7412303702958627, 0.7032136692203778, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996071081130291, 2.000315944932582, 1, 2, 0.3332109158927254, 1.000393046311678, 0.9998420524850676, -0.002389486942043758, 0.7409039490051856, 0.7035404504756657, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809851397301, 2.078919014860269, 1, 0, 0.3070269950465768, 1.08568086426005, 0, -4.708256468744563, 1, 0.3070269950465767, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325679325889981, 0, 1, 0.2246552178863486, 0, 0.4299818934054137, 1.864696245198037, 0.7753447821136514, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333510853567, 1.919151065122253, 0, 1, 0.3428655364560492, 0, 0.5210637235252237, 2.259689497786093, 0.6571344635439509, 1, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9984284444184872, 2.001571555581513, 0, 3, 0.3328094814728291, 0, 1.498822258756778, 6.499920766402708, 0.2969953144289347, 1, 0.2305908506614428],
[0.999607035482861, 2.000392964517139, 0, 1, 0.3332023451609537, 0, 0.4999017781695624, 2.167916796072392, 0.6667976548390464, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9980357545917456, 2.001964245408254, 0, 3, 0.3326785848639152, 0, 1.498528261371731, 6.49864579220402, 0.2971701519273247, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.074337955313448, 1.004282949589628, 0, 0, 0.5168513184772109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000504997267754, 1.999048649546241, 0, 1, 0.3335512929833577, 0, 0.500237950800741, 2.169374671049713, 0.6664487070166423, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991624805653871, 2.000837519434612, 0, 1, 0.3330541601884625, 0, 0.4997907077844959, 2.16743511874327, 0.6669458398115375, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207828501510544, 2, 2, 0, 0.3152520736361603, 2.172064781258578, 0, -9.419561856110407, 0.9999999999999999, 0.09938386993189918, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6954912254252851, 1.814876164159304, 0, 1, 0.2770475860668242, 0, 0.5510017816908325, 2.389521440726294, 0.7229524139331758, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927667776099, 2.140015036804451, 0, 1, 0.2452265556138891, 0, 0.4672864362174001, 2.026474315338199, 0.7547734443861109, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030748253, 2.078634977274203, 1, 2, 0.3070560479106621, 1.085680960990203, 0.9621698960452785, -0.5356286452417195, 0.7750503368684001, 0.6672681873284141, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988220055566359, 2.000947286995056, 0, 2, 0.3329662744520624, 0, 0.9995265807344289, 4.334632436054238, 0.4449339910183612, 1, 0.2305908506614428],
[0.674553581510379, 2.3250534850036, 1, 2, 0.2248806482158071, 1.482461923574582, 0.8601952655712363, -2.698574796954835, 0.8710310982968119, 0.5343005348828846, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2, 8.673371013043498, 0.1975308641975309, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.9996840115651667, 2.000315988434833, 0, 1, 0.3332280038550556, 0, 0.4999210153704065, 2.168000221762478, 0.6667719961449444, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030745843, 2, 1, 0, 0.315321941992466, 1.085680960990487, 0, -4.708256888234048, 1, 0.315321941992466, 0.2305908506614428],
[1.074337955313448, 1.004282949589628, 0, 0, 0.5168513184772109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.9990240651648841, 2.000975934835115, 0, 1, 0.3330080217216281, 0, 0.4997561352892543, 2.167285188704231, 0.666991978278372, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9189084635208682, 2, 2, 0, 0.3148123605124826, 2.176495352253963, 0, -9.438775849131709, 1, 0.0991068223314413, 0.2305908506614428],
[0.6948936692633183, 2.140414134318742, 1, 0, 0.2450857957592492, 1.439069089606379, 0, -6.240790063779433, 1, 0.2450857957592492, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996071882038563, 2.000392811796143, 0, 2, 0.3332023960679522, 0, 0.9998036326696302, 4.33583392316618, 0.4446190446095201, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742559473046122, 2.325744052695385, 0, 1, 0.224751982434871, 0, 0.4299699267600257, 1.864644349620421, 0.7752480175651291, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000392919285471, 0, 1, 0.2519814336935701, 0, 0.4999017894730372, 2.167916845092007, 0.7480185663064299, 1, 0.2305908506614428],
[0.6739398180950441, 2.326060181904953, 0, 1, 0.2246466060316816, 0, 0.4299114905879343, 1.864390930319856, 0.7753533939683184, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214057157712, 1.999709037859662, 0, 1, 0.3334132327655283, 0, 0.5000727511189951, 2.168658251984203, 0.6665867672344717, 1, 0.2305908506614428],
[1.919374510940151, 1.080548591441942, 2, 0, 0.6398079035479506, 1.042006126787813, 0, -4.518852867747574, 0.9999999999999998, 0.4093541534424238, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.0008882529954906859, 2.999111747004505, 0, 1, 0.000296084331830229, 0, 0.3334320573412424, 1.445989970481495, 0.9997039156681697, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368756459525709, 1.305422176633544, 1, 0, 0.5118418197714585, 0.7305901594404256, 0, -3.168339755652707, 1, 0.5118418197714585, 0.2305908506614428],
[0.6743325058084577, 2.32566749419154, 0, 2, 0.2247775019361528, 0, 0.8599681618266974, 3.729411463463989, 0.6009699215043516, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905334781059, 1, 2, 0.3333438520229114, 1, 1.000047334849953, 0.0002052763577426606, 0.7407267157106626, 0.7037177284018568, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625588427602, 2.00083744115724, 0, 1, 0.33305418628092, 0, 0.4997907273374604, 2.167435203538328, 0.66694581371908, 1, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214135172569, 1.999708931816164, 0, 1, 0.3334132618862673, 0, 0.5000727776375863, 2.168658366986994, 0.6665867381137327, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.504152128342632, 2.005624688728024, 1, 0, 0.2008752829787729, 1.983528272086119, 0, -8.601938309331999, 1, 0.2008752829787729, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991610347415311, 2.000838965258469, 0, 2, 0.333053678247177, 0, 0.9995806932626581, 4.334867105071131, 0.4448173960996201, 1, 0.2305908506614428],
[0.8346691501419569, 2.000836947073377, 0, 1, 0.2943633769511766, 0, 0.4997908507550801, 2.16743573876173, 0.7056366230488234, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990523388090846, 2.000947661190915, 0, 2, 0.3330174462696949, 0, 0.9995263938136436, 4.334631625437578, 0.4448657269805994, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.921080916460832, 2.000094693506511, 1, 1, 0.3153117235807433, 1.085680945212075, 0.4999763277441767, -2.540016725675898, 0.900578516972541, 0.5312019641340274, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905279934755, 0, 1, 0.3333438581173299, 0, 0.5000236811378506, 2.168445450908169, 0.6666561418826701, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990240661345865, 2.000975933865413, 0, 2, 0.3330080220448622, 0, 0.9995122710628868, 4.334570379509058, 0.4448782986565071, 1, 0.2305908506614428],
[0.999905286769096, 2.000094713230904, 1, 1, 0.3333017622563653, 1.00009472220235, 0.4999763228135454, -2.168856214174284, 0.8889099352768013, 0.5555134597895319, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9936414567164272, 2.00635854328357, 3, 0, 0.331213818905476, 3.019197699252359, 0, -13.09331090367152, 0.9999999999999998, 0.03633501504757897, 0.2305908506614428],
[1.000444508633568, 1.920636410058445, 0, 1, 0.3424911998266525, 0, 0.5206607532602019, 2.257941942478214, 0.6575088001733475, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325351778058695, 0, 2, 0.2246797527529984, 0, 0.8600849208585924, 3.729917810665363, 0.6011214857911517, 1, 0.2305908506614428],
[0.5041263719331219, 2.006240686437181, 0, 1, 0.2008177928610942, 0, 0.4984446815181822, 2.16159782614275, 0.7991822071389059, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742100481637049, 2.325789951836293, 1, 0, 0.2247366827212351, 1.483217289216654, 0, -6.432246921168339, 1, 0.2247366827212351, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043567209136374, 2.331149383911023, 1, 1, 0.1778718515384136, 1.982723652791837, 0.4289729379428601, -6.738128205833362, 0.9683616044302967, 0.3241053075071236, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.001255634187915491, 2.998744365812081, 0, 2, 0.000418544729305164, 0, 0.6669458133215652, 2.892334242266992, 0.9991630857210801, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.384408440711103, 0, 1, 0.334269351611849, 0, 0.7223301813201518, 3.132518828254329, 0.6657306483881511, 1, 0.2305908506614428],
[0.5041263719331218, 2.331379725282208, 0, 1, 0.1777906146730596, 0, 0.4289305552225956, 1.860136922138157, 0.8222093853269404, 1, 0.2305908506614428],
[0.6739610167318298, 2.000177221562656, 0, 0.75, 0.2520292358414759, 0, 0.3749667739011927, 1.62611297380452, 0.8042914782705335, 1, 0.2305908506614428],
[0.999607021299029, 2, 0, 1, 0.3332459932921923, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6667540067078077, 1, 0.2305908506614428],
[0.9981862104815298, 2.00181378951847, 0, 2, 0.3327287368271766, 0, 0.9990939269536622, 4.332756152673846, 0.4452509386562555, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999051831667572, 2.000094816833243, 0, 1, 0.3333017277222524, 0, 0.4999762969154151, 2.168239960437495, 0.6666982722777476, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742553342197467, 2.325253578293598, 0, 2.75, 0.2247885750253616, 0, 1.182666710276866, 5.128853581503439, 0.4964842236435025, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999001759953461, 2.000099824004654, 0, 3, 0.3333000586651154, 0, 1.499925135733135, 6.504703597001554, 0.2963406647350308, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2, 0, 0, 0.3153918286891671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2, 0, 0, 0.3153918286891671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.99921386776885, 2.00078613223115, 0, 2, 0.3330712892562833, 0, 0.9996070883246911, 4.334981572154094, 0.4447939052142762, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999052736760479, 2.000094726323952, 0, 1, 0.3333017578920159, 0, 0.4999763195405935, 2.168240058555778, 0.6666982421079841, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9987951598455929, 2.001204840154407, 0, 1, 0.3329317199485309, 0, 0.4996989713071266, 2.167037286491443, 0.6670682800514691, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809186920146, 2.004593732601037, 1, 0, 0.3148268445655524, 1.085680942582173, 0, -4.70825680840298, 1, 0.3148268445655524, 0.2305908506614428],
[0.9996070904751088, 2.000392909524891, 0, 1, 0.3332023634917029, 0, 0.4999017919122238, 2.167916855669992, 0.666797636508297, 1, 0.2305908506614428],
[0.6739141256190869, 2.32386104627124, 0, 1, 0.2248047591888395, 0, 0.430318328027639, 1.866155256348134, 0.7751952408111605, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992124856715845, 2.000787514328415, 0, 1, 0.3330708285571948, 0, 0.4998031989097354, 2.167489288825056, 0.6669291714428052, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950256, 2.325839083904972, 1, 0, 0.2247203053650087, 1.48332538437907, 0, -6.432715695892516, 1, 0.2247203053650086, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920713751110427, 1.07889342406735, 1, 0, 0.6403217617975568, 0.5206397879027355, 0, -2.25785102231635, 1, 0.6403217617975568, 0.2305908506614428],
[0.6741609012211044, 2.261953286690342, 1, 0, 0.2296099054991648, 1.483325417105479, 0, -6.432715837816657, 1, 0.2296099054991648, 0.2305908506614428],
[0.5049470890614834, 2.007787464473951, 0, 1, 0.2009552056945368, 0, 0.4980606850546326, 2.159932554244719, 0.7990447943054632, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[1.364902737443219, 1.310457018516044, 1, 1, 0.510175401421416, 0.7326529375076448, 0.763092559214491, 0.1320070662800848, 0.739721059784497, 0.7600718626273291, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.177177810801092, 1.759025886067147, 0, 1, 0.4009183055169749, 0, 0.5684964660956826, 2.465390385025979, 0.5990816944830251, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3078308691796601, 2.691776530104748, 0, 2, 0.1026237197751602, 0, 0.7430037291848191, 3.222173503647415, 0.8052841883101702, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.0000896275375, 1.9999103724625, 15, 0, 0.3333632091791668, 14.99865570742313, 0, -65.04445282369159, 1.000000000000001, 6.978547129055102e-08, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.00044418039713, 1.999163220774955, 0, 1, 0.3335250406457226, 0, 0.50020928236783, 2.169250345072213, 0.6664749593542774, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043567075961201, 2.006010373368273, 1, 1, 0.2009095448313337, 1.98272370514557, 0.4985019087019523, -6.436603153100711, 0.9596353547956663, 0.3614544444583337, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927021526817, 2.140015101429379, 0, 1, 0.2452265328209746, 0, 0.46728642210612, 2.026474254142014, 0.7547734671790254, 1, 0.2305908506614428],
[0.921081063834194, 2.078918936165806, 1, 0, 0.3070270212780647, 1.085680771502662, 0, -4.708256066484942, 1, 0.3070270212780647, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.00064231661682, 1.999126916289079, 1, 1, 0.3335730981037799, 0.9993580956889855, 0.5002183662537398, -2.164612030371017, 0.8887289882214461, 0.5558751844290057, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333420178032, 1.919156374656008, 1, 1, 0.342864892713975, 0.9986683554636625, 0.5210622819514856, -2.071227336827018, 0.8824436653442345, 0.5681734507721845, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999053451777401, 2.00009465482226, 2, 1, 0.3333017817259133, 2.000189327565287, 0.499976337414324, -6.505951931083334, 0.9629734791699635, 0.2592171914449329, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991624871222781, 2.000837512877722, 0, 1, 0.3330541623740927, 0, 0.4997907094223465, 2.167435125846113, 0.6669458376259073, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043313629290652, 2.006627026089789, 0, 1, 0.2008521388226311, 0, 0.4983487150318355, 2.161181649672298, 0.7991478611773688, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905314441802, 0, 2, 0.3333438542829715, 0, 1.000047345020544, 4.336890826986146, 0.4444304166222839, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033867891, 2.325839096613208, 1, 0, 0.2247203011289299, 1.483325412340421, 0, -6.432715817152102, 1, 0.2247203011289299, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921384253129991, 1, 0, 0.3423034812789839, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3423034812789838, 0.2305908506614428],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.9958119975606438, 2.004188002439356, 1, 1, 0.3319373325202146, 1.004205615567612, 0.498955187229377, -2.191112209738331, 0.8898176072793645, 0.5536922723197937, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000392826727628, 0, 1, 0.2519814424148225, 0, 0.4999018126034099, 2.167916945401159, 0.7480185575851775, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9980201139556942, 2.001592130007088, 0, 1, 0.3327163755796688, 0, 0.4996022841059325, 2.166617984507359, 0.6672836244203312, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.5044347710127651, 2.331075422462485, 0, 1, 0.177899121002461, 0, 0.4289865485963671, 1.860379747790653, 0.822100878997539, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000315863028263, 0, 1, 0.2519886945196809, 0, 0.4999210467121466, 2.168000357681748, 0.748011305480319, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.9207828189775467, 2, 2, 0, 0.3152520663278474, 2.172064854794788, 0, -9.419562175013823, 1, 0.09938386532397736, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 3.75, 0.3333333333333333, 0, 1.875, 8.131285324728278, 0.2186038359901871, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920048309875481, 1.079165983063751, 2, 0, 0.640183768927639, 1.04164045754125, 0, -4.517267075225821, 1, 0.4098352579983966, 0.2305908506614428],
[0.999368162041738, 2.000631837958262, 1, 2, 0.3331227206805794, 1.000632237429869, 0.9996841807941502, -0.004111423471482706, 0.7410215132347053, 0.7034227981086438, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.917483328183062, 1.082516671816936, 0, 1, 0.6391611093943543, 0, 0.9237733016356808, 4.0061142885152, 0.3608388906056457, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9206116291664541, 2.079388370833545, 1, 0, 0.3068705430554847, 1.086234377579421, 0, -4.710656881934348, 1, 0.3068705430554848, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921568696494452, 0, 1, 0.342281871105713, 0, 0.5204081445666323, 2.256846458017989, 0.657718128894287, 1, 0.2305908506614428],
[0.9987951239237024, 2.001204876076297, 0, 1, 0.3329317079745675, 0, 0.4996989623374645, 2.16703724759284, 0.6670682920254325, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988218121183393, 2.00117818788166, 0, 1, 0.3329406040394465, 0, 0.4997056264432636, 2.167066147723872, 0.6670593959605535, 1, 0.2305908506614428],
[0.0008882530807573206, 2.999111746919239, 0, 1, 0.0002960843602524405, 0, 0.333432057350722, 1.445989970522605, 0.9997039156397476, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.3073872726197112, 2.692612727380289, 0, 1, 0.1024624242065704, 0, 0.3713864938063058, 1.610586425007736, 0.8975375757934296, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.002411590120526863, 2.997588409879469, 0, 1, 0.0008038633735089551, 0, 0.333601503363235, 1.446724804589207, 0.9991961366264911, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996840574315479, 2.000315942568452, 0, 1, 0.3332280191438494, 0, 0.4999210268333796, 2.168000271473788, 0.6667719808561506, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.074248450506484, 1.925751549493513, 1, 0, 0.358082816835495, 0.930883353407233, 0, -4.03694834698351, 1, 0.358082816835495, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.261314204724325, 0, 1, 0.2295816534508691, 0, 0.4422207218752731, 1.917772195240082, 0.770418346549131, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9214738730760099, 2.07852612692399, 0, 1, 0.3071579576920033, 0, 0.4811101419638635, 2.086423379695308, 0.6928420423079966, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214057157712, 1.999709037859662, 0, 1, 0.3334132327655283, 0, 0.5000727511189951, 2.168658251984203, 0.6665867672344717, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.177177810745453, 1.759025886129838, 0, 1, 0.4009183054970628, 0, 0.5684964660754217, 2.465390384938114, 0.5990816945029371, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992141896949132, 2.000785810305087, 0, 1, 0.333071396564971, 0, 0.4998036245806424, 2.167491134825909, 0.666928603435029, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.504090591878956, 2.331415562124455, 0, 1, 0.1777779925348558, 0, 0.4289239620107753, 1.860108329452014, 0.8222220074651442, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6948937778870524, 2.140414025695008, 1, 0, 0.2450858340703398, 1.439068864655368, 0, -6.240789088237642, 1, 0.2450858340703398, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325744303564282, 0, 1, 0.2246503513911253, 0, 0.4299698803808597, 1.864644148488564, 0.7753496486088747, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9208083291340963, 2.078600821074217, 1, 2, 0.3069965726650347, 1.086002339857605, 0.9621857067132322, -0.5369537984235212, 0.7751262610000447, 0.6671825050530094, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333218429481, 1.919151553704423, 0, 1, 0.3428654132984364, 0, 0.5210635908715807, 2.259688922508962, 0.6571345867015636, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.004282949589627, 0, 0, 0.3149301187299771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.003868768022784227, 2.996131231977212, 0, 2, 0.001289589340928077, 0, 0.6675275030193375, 2.894856847548614, 0.9974224843588122, 1, 0.2305908506614428],
[0.6753391236314109, 2.324660876368587, 1, 1, 0.2251130412104705, 1.480737550969702, 0.4301702713567951, -4.555979895123274, 0.9493241186769729, 0.3995502010979141, 0.2305908506614428],
[0.6741609160951255, 2, 1, 0, 0.2521018507291444, 1.483325384378851, 0, -6.432715695891563, 1, 0.2521018507291444, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988221594403961, 2.001177840559604, 1, 1, 0.3329407198134653, 1.001179229503943, 0.4997057131715804, -2.174732930183054, 0.8891504770900918, 0.5550319167170221, 0.2305908506614428],
[0.9954114093009908, 2.004588590699007, 1, 1, 0.3318038031003305, 1.004609742922508, 0.4988554781962999, -2.193297189699711, 0.889906236248157, 0.5535138424488182, 0.2305908506614428],
[0.9911949728818731, 2.008805027118127, 1, 3, 0.3303983242939577, 1.008883244325308, 1.493425175415785, 2.101305969862132, 0.5978102850858183, 0.7989675676669569, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950456, 2.325839083904952, 1, 0, 0.2247203053650154, 1.483325384379026, 0, -6.432715695892326, 1, 0.2247203053650153, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.000444508633568, 1.920636410058445, 0, 1, 0.3424911998266525, 0, 0.5206607532602019, 2.257941942478214, 0.6575088001733475, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9260468849523193, 2.089151386465719, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6473687186696796, 2.367829552748355, 0, 0, 0.2147018737727071, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.390505884856328, 0, 0, 0.3344159289439092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.3064205888632906, 2.708777682554748, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333333333333333, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989918890865581, 0, -8.673371013043496, 1, 0.1111111111111109, 0.2294285448959845],
[1.00422456262443, 2.010973708793609, 0, 2, 0.3330542379729298, 0, 0.9945430868908814, 4.334870743053246, 0.4448166494858694, 1, 0.2294285448959845],
[0.839539548487548, 2.010132180945359, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.823846071882781, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.9254034658267191, 2.089794805591319, 2, 0, 0.3069129730535116, 2.161219483021148, 0, -9.420011289357976, 1, 0.09419557302854553, 0.2294285448959845],
[0.9996292664441121, 2.000370733555888, 0, 0.75, 0.3332097554813707, 0, 0.3749305003411988, 1.625955666782625, 0.7378905151212388, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625961535968, 2.000837403846403, 0, 1, 0.3330541987178656, 0, 0.4997907366573632, 2.167435243955815, 0.6669458012821343, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078526126923995, 0, 1, 0.3071360682775925, 0, 0.4811101419638624, 2.086423379695303, 0.6928639317224075, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 6, 0.3333333333333333, 1, 3, 8.673371013043498, 0.263374485596708, 0.9414723365340649, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8350775253160704, 2.00042862868734, 1, 0, 0.2945073930229481, 1.197493609496325, 0, -5.193153180455128, 1, 0.2945073930229481, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 3, 1, 0.3333333333333333, 3, 0.5, -10.84171376630437, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5040735681535882, 1.575370411534826, 0, 1, 0.2424078614655053, 0, 0.6347713481718477, 2.752803705572123, 0.7575921385344947, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033869312, 2.325839096613066, 1, 0, 0.2247203011289773, 1.483325412340109, 0, -6.432715817150746, 0.9999999999999999, 0.2247203011289773, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921473872975555, 1, 0, 0.3422929806938469, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3422929806938468, 0.2305908506614428],
[0.5043567061616963, 2.331149398662964, 1, 1, 0.1778718463358358, 1.982723710784567, 0.4289729352282406, -6.738128469102048, 0.9683616062810809, 0.3241052989527523, 0.2305908506614428],
[0.7380467737969596, 2.261953226203038, 1, 0, 0.2460155912656534, 1.354927675999984, 0, -5.875895214894324, 1, 0.2460155912656534, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.510367201649412, 1, 0, 0.3983480979766467, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3983480979766467, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001110019368573, 1.998889980631427, 0, 1, 0.3337033397895243, 0, 0.500277658945547, 2.169546872785784, 0.6662966602104756, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996840551777112, 2.000315944822288, 0, 1, 0.3332280183925704, 0, 0.4999210262700984, 2.168000269031014, 0.6667719816074296, 1, 0.2305908506614428],
[0.6950983103849246, 1.384633322625419, 0, 1, 0.3342250025686211, 0, 0.7222128657888205, 3.132010067689915, 0.6657749974313789, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950456, 2.325839083904952, 1, 0, 0.2247203053650154, 1.483325384379026, 0, -6.432715695892326, 1, 0.2247203053650153, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6747565801591237, 2.037583439747417, 1, 1, 0.2487728585674792, 1.482015929009801, 0.490777447682811, -4.298689555477387, 0.9381120648401651, 0.4356577819751234, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.823846071882781, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333333333333333, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.9257050513967047, 2.089493220021334, 1, 0, 0.3070129948573327, 1.080257689521299, 0, -4.708471171322876, 1, 0.3070129948573328, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.273724839104528, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.337921634662914, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8340297564467517, 2.001674864241484, 0, 1, 0.2941172893544637, 0, 0.4995816342925106, 2.16652843276078, 0.7058827106455363, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000495442437606, 1.998326109193858, 0, 4, 0.3336295358732838, 0, 2.001675292934863, 8.680636231633295, 0.1971800432285939, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.3057132459258353, 2.694286754074165, 0, 1, 0.1019044153086118, 0, 0.3711557422341368, 1.609585728009103, 0.8980955846913883, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.004282949589627, 0, 0, 0.3149301187299771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.003032750789964437, 2.996967249210032, 0, 2, 0.001010916929988147, 0, 0.6673412932781224, 2.894049314462713, 0.9979791880930631, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207825130978278, 2.079217486902172, 1, 0, 0.3069275043659426, 1.086032788172375, 0, -4.709782652074542, 1, 0.3069275043659426, 0.2305908506614428],
[0.99929124194083, 2.00070875805917, 0, 2, 0.3330970806469433, 0, 0.9996457465104228, 4.335149220547865, 0.4447595038416296, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809187234005, 2.078919081276599, 1, 0, 0.3070269729078002, 1.085680942545178, 0, -4.708256808242545, 1, 0.3070269729078001, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6955806350798546, 1.38304026982322, 0, 1, 0.3346356391582088, 0, 0.7230447455646537, 3.135617668656939, 0.6653643608417912, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990240661308644, 2.000975933869135, 0, 1, 0.3330080220436215, 0, 0.4997561355305138, 2.167285189750498, 0.6669919779563784, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033867831, 2.325839096613215, 1, 0, 0.2247203011289279, 1.483325412340435, 0, -6.43271581715216, 1, 0.2247203011289278, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951661335156835, 1.815200965948696, 1, 1, 0.2769181183357632, 1.438505059132659, 0.5509031885499028, -3.84925016771783, 0.9233163557373802, 0.4771525924089066, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6447944899630274, 2.355007080797558, 0, 2, 0.2149457138258458, 0, 0.8492543467523972, 3.682949016911716, 0.6163102322404109, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905338411757, 0, 2, 0.3333438516194751, 0, 1.000047333034431, 4.336890775006148, 0.4444304201735564, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428]
],
"RESOLVED": [
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989918890865581, 0, -8.673371013043496, 1, 0.1111111111111109, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.009538893246058, 1, 0, 0.3333989348192665, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333989348192665, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.273724839104528, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.9989040583873496, 2.000547970806325, 0, 2, 0.3330288494915117, 0, 0.9997260896442767, 4.335497643451997, 0.4448505156106166, 1, 0.2305908506614428],
[0.920484783070691, 2.005215072252849, 1, 0, 0.3146203741288762, 1.086384064562208, 0, -4.711306027303118, 1, 0.3146203741288762, 0.2305908506614428],
[0.6741608496886017, 2.325839150311396, 1, 0, 0.2247202832295341, 1.483325530490098, 0, -6.43271632953009, 1, 0.2247202832295341, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.505028259782623, 0.2962962962962963, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809186920152, 2.004593732601037, 1, 0, 0.3148268445655527, 1.085680942582172, 0, -4.708256808402975, 1, 0.3148268445655527, 0.2305908506614428],
[0.3057132823599206, 2.69428671764008, 0, 1, 0.1019044274533068, 0, 0.371155747253172, 1.609585749775081, 0.8980955725466931, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999810529181635, 0, 1, 0.3333543869761686, 0, 0.5000473721924151, 2.168548191561133, 0.6666456130238314, 1, 0.2305908506614428],
[0.921080988440667, 2.078919011559333, 1, 0, 0.3070269961468891, 1.085680860369226, 0, -4.708256451871283, 1, 0.307026996146889, 0.2305908506614428],
[1.368756459525656, 1.305422176633668, 1, 0, 0.511841819771425, 0.7305901594404537, 0, -3.168339755652829, 1, 0.511841819771425, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809164608258, 2.004593734926559, 1, 0, 0.3148268437927778, 1.085680945212082, 0, -4.708256819808068, 1, 0.3148268437927778, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207827628243315, 2, 2, 0, 0.3152520531632949, 2.17206498725646, 0, -9.419562749458439, 1, 0.09938385702367292, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6734532524326465, 2.32432635081991, 0, 1, 0.2246506886970468, 0, 0.4302321830354194, 1.865781672608915, 0.7753493113029533, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000889418171132, 1.919987748696072, 0, 2, 0.3426674115312555, 0, 1.041673313466853, 4.517409561042186, 0.4320861318630198, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927667776099, 2.140015036804451, 0, 1, 0.2452265556138891, 0, 0.4672864362174001, 2.026474315338199, 0.7547734443861109, 1, 0.2305908506614428],
[1.368542419775476, 1.305713078721382, 0, 1, 0.5117470714913758, 0, 0.7658650405640794, 3.321315821365935, 0.4882529285086242, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.177177810745453, 1.759025886129838, 0, 1, 0.4009183054970628, 0, 0.5684964660754217, 2.465390384938114, 0.5990816945029371, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001293589543713, 1.998437812864874, 2, 2, 0.3337944153065638, 1.997416163336665, 1.000781704151648, -4.322090214447806, 0.8884786130529814, 0.4082271083011879, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9984206292315037, 2.001579370768496, 0, 1, 0.3328068764105012, 0, 0.4996054688633482, 2.166631795798685, 0.6671931235894988, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030741314, 2.00459374887923, 1, 0, 0.3148268391562817, 1.085680960991021, 0, -4.708256888236363, 1, 0.3148268391562817, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.324958718260123, 0, 1, 0.2247092018476538, 0, 0.4301151638289506, 1.865274197112238, 0.7752907981523462, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001109969536228, 1.998511223320606, 0, 5, 0.3337454649007772, 0, 2.501862357166202, 10.849790223635, 0.1312807022303867, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992146971984904, 2.000631503090054, 0, 2, 0.3330886420451754, 0, 0.999684348122541, 4.335316623599666, 0.4447707593691482, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6738884358005753, 2.325520172001505, 0, 1, 0.2246737687048216, 0, 0.4300113204949456, 1.864823861230709, 0.7753262312951784, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999051830706382, 2.000094816929362, 0, 1, 0.3333017276902128, 0, 0.4999762968913876, 2.168239960333295, 0.6666982723097872, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.6953965107178054, 1.384334380794986, 0, 1, 0.3343685058272013, 0, 0.7223688249552298, 3.132686413546491, 0.6656314941727988, 1, 0.2305908506614428],
[1.001264976951781, 1.998735023048219, 1, 0, 0.3337549923172602, 0.9987366211932911, 0, -4.331206629961447, 1, 0.3337549923172602, 0.2305908506614428],
[0.9207827922478655, 2, 2, 0, 0.3152520600613445, 2.172064917848313, 0, -9.41956244845713, 1, 0.09938386137292154, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.00140183953363388, 2.998598160466362, 0, 1, 0.0004672798445446272, 0, 0.3334891660990258, 1.446237633203669, 0.9995327201554554, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6948936726151935, 2.140414130966867, 1, 0, 0.2450857969414401, 1.439069082664915, 0, -6.240790033676483, 0.9999999999999999, 0.2450857969414402, 0.2305908506614428],
[1.000888765453543, 1.919988815536508, 0, 3, 0.3426671394815132, 0, 1.562509101992712, 6.776110576420107, 0.2840246481458745, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001664753009622, 1.998335246990378, 1, 2, 0.3338882510032075, 0.9983380137869279, 1.00083306993265, 0.01082027382511103, 0.740000542922377, 0.7044429782338397, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 2.168342753260875, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6743199789490487, 2.325680021050949, 0, 1, 0.2247733263163498, 0, 0.4299817648810137, 1.864695687828134, 0.7752266736836502, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996073224212553, 2.000315772596119, 0, 1, 0.3332109826686961, 0, 0.4999210693130443, 2.168000455694734, 0.6667890173313039, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609160005722, 2, 1, 0, 0.2521018507027002, 1.483325384586892, 0, -6.432715696793773, 1, 0.2521018507027002, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741607015216219, 2.325839298478376, 1, 0, 0.2247202338405408, 1.483325856495253, 0, -6.432717743311921, 1, 0.2247202338405409, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9995536891838138, 2.000446310816186, 0, 1, 0.3331845630612713, 0, 0.4998884471895664, 2.167858983804655, 0.6668154369387287, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9212650510544361, 2.078734948945563, 1, 2, 0.3070883503514787, 1.085463948573158, 0.9621236228382548, -0.5348882029842246, 0.775009097208516, 0.6673147172763054, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033868524, 2.325839096613145, 1, 0, 0.224720301128951, 1.483325412340282, 0, -6.432715817151498, 1, 0.224720301128951, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809097677342, 2.078919090232266, 1, 0, 0.3070269699225781, 1.08568095310125, 0, -4.708256854020909, 1, 0.3070269699225781, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625588427583, 2.000837441157242, 0, 1, 0.3330541862809194, 0, 0.4997907273374599, 2.167435203538326, 0.6669458137190806, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742555598103698, 2.325744440189628, 0, 1, 0.2247518532701235, 0, 0.4299698551223736, 1.864644038950453, 0.7752481467298765, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809906076789, 2, 1, 0, 0.3153219625095244, 1.085680857814962, 0, -4.708256440794246, 1, 0.3153219625095244, 0.2305908506614428],
[0.7386834704075685, 2.261316529592429, 0, 1, 0.2462278234691897, 0, 0.442220267226471, 1.917770223571211, 0.7537721765308103, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207826280231819, 2.079217371976818, 1, 2, 0.306927542674394, 1.086032652621704, 0.961900389519398, -0.5383225862875152, 0.7752143721305448, 0.6670830394102417, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.999050906840436, 2.000949093159564, 0, 1, 0.333016968946812, 0, 0.4997628392539299, 2.167314261690676, 0.666983031053188, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8351389007175476, 2.000168902864518, 0, 1, 0.2945496427803894, 0, 0.4999577778495916, 2.168159649073144, 0.7054503572196107, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.5040905085577506, 2.331415547557415, 0, 1, 0.1777779692872138, 0, 0.4289239646907577, 1.860108341074255, 0.8222220307127862, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.001110231642532, 1.998889768357468, 1, 0, 0.3337034105475105, 0.9988909996047988, 0, -4.331876120581152, 1, 0.3337034105475105, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996317889384981, 2.000368211061502, 0, 1, 0.3332105963128327, 0, 0.4999079641789282, 2.167943622849551, 0.6667894036871673, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609012211053, 2.325839098778892, 1, 0, 0.2247203004070353, 1.483325417105477, 0, -6.432715837816648, 1, 0.2247203004070353, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920483299542142, 1.079439753503469, 1, 0, 0.6401775197508517, 0.520702262934756, 0, -2.258121956882233, 1, 0.6401775197508517, 0.2305908506614428],
[0.9996071900375542, 2.000392809962446, 0, 1, 0.3332023966791847, 0, 0.4999018167930595, 2.167916963570352, 0.6667976033208153, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988980296933084, 2.001101970306691, 1, 2, 0.3329660098977695, 1.00110318598489, 0.9994493182641151, -0.007172304174386808, 0.7412303702958627, 0.7032136692203778, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996071081130291, 2.000315944932582, 1, 2, 0.3332109158927254, 1.000393046311678, 0.9998420524850676, -0.002389486942043758, 0.7409039490051856, 0.7035404504756657, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809851397301, 2.078919014860269, 1, 0, 0.3070269950465768, 1.08568086426005, 0, -4.708256468744563, 1, 0.3070269950465767, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325679325889981, 0, 1, 0.2246552178863486, 0, 0.4299818934054137, 1.864696245198037, 0.7753447821136514, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333510853567, 1.919151065122253, 0, 1, 0.3428655364560492, 0, 0.5210637235252237, 2.259689497786093, 0.6571344635439509, 1, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9984284444184872, 2.001571555581513, 0, 3, 0.3328094814728291, 0, 1.498822258756778, 6.499920766402708, 0.2969953144289347, 1, 0.2305908506614428],
[0.999607035482861, 2.000392964517139, 0, 1, 0.3332023451609537, 0, 0.4999017781695624, 2.167916796072392, 0.6667976548390464, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9980357545917456, 2.001964245408254, 0, 3, 0.3326785848639152, 0, 1.498528261371731, 6.49864579220402, 0.2971701519273247, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.074337955313448, 1.004282949589628, 0, 0, 0.5168513184772109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000504997267754, 1.999048649546241, 0, 1, 0.3335512929833577, 0, 0.500237950800741, 2.169374671049713, 0.6664487070166423, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991624805653871, 2.000837519434612, 0, 1, 0.3330541601884625, 0, 0.4997907077844959, 2.16743511874327, 0.6669458398115375, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.005855058499209, 0, 0, 0.2007834940317963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207828501510544, 2, 2, 0, 0.3152520736361603, 2.172064781258578, 0, -9.419561856110407, 0.9999999999999999, 0.09938386993189918, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6954912254252851, 1.814876164159304, 0, 1, 0.2770475860668242, 0, 0.5510017816908325, 2.389521440726294, 0.7229524139331758, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927667776099, 2.140015036804451, 0, 1, 0.2452265556138891, 0, 0.4672864362174001, 2.026474315338199, 0.7547734443861109, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030748253, 2.078634977274203, 1, 2, 0.3070560479106621, 1.085680960990203, 0.9621698960452785, -0.5356286452417195, 0.7750503368684001, 0.6672681873284141, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988220055566359, 2.000947286995056, 0, 2, 0.3329662744520624, 0, 0.9995265807344289, 4.334632436054238, 0.4449339910183612, 1, 0.2305908506614428],
[0.674553581510379, 2.3250534850036, 1, 2, 0.2248806482158071, 1.482461923574582, 0.8601952655712363, -2.698574796954835, 0.8710310982968119, 0.5343005348828846, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2, 8.673371013043498, 0.1975308641975309, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.9996840115651667, 2.000315988434833, 0, 1, 0.3332280038550556, 0, 0.4999210153704065, 2.168000221762478, 0.6667719961449444, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809030745843, 2, 1, 0, 0.315321941992466, 1.085680960990487, 0, -4.708256888234048, 1, 0.315321941992466, 0.2305908506614428],
[1.074337955313448, 1.004282949589628, 0, 0, 0.5168513184772109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.9990240651648841, 2.000975934835115, 0, 1, 0.3330080217216281, 0, 0.4997561352892543, 2.167285188704231, 0.666991978278372, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9189084635208682, 2, 2, 0, 0.3148123605124826, 2.176495352253963, 0, -9.438775849131709, 1, 0.0991068223314413, 0.2305908506614428],
[0.6948936692633183, 2.140414134318742, 1, 0, 0.2450857957592492, 1.439069089606379, 0, -6.240790063779433, 1, 0.2450857957592492, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996071882038563, 2.000392811796143, 0, 2, 0.3332023960679522, 0, 0.9998036326696302, 4.33583392316618, 0.4446190446095201, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742559473046122, 2.325744052695385, 0, 1, 0.224751982434871, 0, 0.4299699267600257, 1.864644349620421, 0.7752480175651291, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000392919285471, 0, 1, 0.2519814336935701, 0, 0.4999017894730372, 2.167916845092007, 0.7480185663064299, 1, 0.2305908506614428],
[0.6739398180950441, 2.326060181904953, 0, 1, 0.2246466060316816, 0, 0.4299114905879343, 1.864390930319856, 0.7753533939683184, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214057157712, 1.999709037859662, 0, 1, 0.3334132327655283, 0, 0.5000727511189951, 2.168658251984203, 0.6665867672344717, 1, 0.2305908506614428],
[1.919374510940151, 1.080548591441942, 2, 0, 0.6398079035479506, 1.042006126787813, 0, -4.518852867747574, 0.9999999999999998, 0.4093541534424238, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.0008882529954906859, 2.999111747004505, 0, 1, 0.000296084331830229, 0, 0.3334320573412424, 1.445989970481495, 0.9997039156681697, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368756459525709, 1.305422176633544, 1, 0, 0.5118418197714585, 0.7305901594404256, 0, -3.168339755652707, 1, 0.5118418197714585, 0.2305908506614428],
[0.6743325058084577, 2.32566749419154, 0, 2, 0.2247775019361528, 0, 0.8599681618266974, 3.729411463463989, 0.6009699215043516, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905334781059, 1, 2, 0.3333438520229114, 1, 1.000047334849953, 0.0002052763577426606, 0.7407267157106626, 0.7037177284018568, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625588427602, 2.00083744115724, 0, 1, 0.33305418628092, 0, 0.4997907273374604, 2.167435203538328, 0.66694581371908, 1, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214135172569, 1.999708931816164, 0, 1, 0.3334132618862673, 0, 0.5000727776375863, 2.168658366986994, 0.6665867381137327, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.504152128342632, 2.005624688728024, 1, 0, 0.2008752829787729, 1.983528272086119, 0, -8.601938309331999, 1, 0.2008752829787729, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991610347415311, 2.000838965258469, 0, 2, 0.333053678247177, 0, 0.9995806932626581, 4.334867105071131, 0.4448173960996201, 1, 0.2305908506614428],
[0.8346691501419569, 2.000836947073377, 0, 1, 0.2943633769511766, 0, 0.4997908507550801, 2.16743573876173, 0.7056366230488234, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990523388090846, 2.000947661190915, 0, 2, 0.3330174462696949, 0, 0.9995263938136436, 4.334631625437578, 0.4448657269805994, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.921080916460832, 2.000094693506511, 1, 1, 0.3153117235807433, 1.085680945212075, 0.4999763277441767, -2.540016725675898, 0.900578516972541, 0.5312019641340274, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905279934755, 0, 1, 0.3333438581173299, 0, 0.5000236811378506, 2.168445450908169, 0.6666561418826701, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990240661345865, 2.000975933865413, 0, 2, 0.3330080220448622, 0, 0.9995122710628868, 4.334570379509058, 0.4448782986565071, 1, 0.2305908506614428],
[0.999905286769096, 2.000094713230904, 1, 1, 0.3333017622563653, 1.00009472220235, 0.4999763228135454, -2.168856214174284, 0.8889099352768013, 0.5555134597895319, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9936414567164272, 2.00635854328357, 3, 0, 0.331213818905476, 3.019197699252359, 0, -13.09331090367152, 0.9999999999999998, 0.03633501504757897, 0.2305908506614428],
[1.000444508633568, 1.920636410058445, 0, 1, 0.3424911998266525, 0, 0.5206607532602019, 2.257941942478214, 0.6575088001733475, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325351778058695, 0, 2, 0.2246797527529984, 0, 0.8600849208585924, 3.729917810665363, 0.6011214857911517, 1, 0.2305908506614428],
[0.5041263719331219, 2.006240686437181, 0, 1, 0.2008177928610942, 0, 0.4984446815181822, 2.16159782614275, 0.7991822071389059, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742100481637049, 2.325789951836293, 1, 0, 0.2247366827212351, 1.483217289216654, 0, -6.432246921168339, 1, 0.2247366827212351, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043567209136374, 2.331149383911023, 1, 1, 0.1778718515384136, 1.982723652791837, 0.4289729379428601, -6.738128205833362, 0.9683616044302967, 0.3241053075071236, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.001255634187915491, 2.998744365812081, 0, 2, 0.000418544729305164, 0, 0.6669458133215652, 2.892334242266992, 0.9991630857210801, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.384408440711103, 0, 1, 0.334269351611849, 0, 0.7223301813201518, 3.132518828254329, 0.6657306483881511, 1, 0.2305908506614428],
[0.5041263719331218, 2.331379725282208, 0, 1, 0.1777906146730596, 0, 0.4289305552225956, 1.860136922138157, 0.8222093853269404, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.999607021299029, 2, 0, 1, 0.3332459932921923, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6667540067078077, 1, 0.2305908506614428],
[0.9981862104815298, 2.00181378951847, 0, 2, 0.3327287368271766, 0, 0.9990939269536622, 4.332756152673846, 0.4452509386562555, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999051831667572, 2.000094816833243, 0, 1, 0.3333017277222524, 0, 0.4999762969154151, 2.168239960437495, 0.6666982722777476, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6742553342197467, 2.325351926998121, 0, 2, 0.2247812048387938, 0, 0.8600848657699183, 3.729917571763108, 0.6009641803711921, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999001759953461, 2.000099824004654, 0, 3, 0.3333000586651154, 0, 1.499925135733135, 6.504703597001554, 0.2963406647350308, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2, 0, 0, 0.3153918286891671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2, 0, 0, 0.3153918286891671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.99921386776885, 2.00078613223115, 0, 2, 0.3330712892562833, 0, 0.9996070883246911, 4.334981572154094, 0.4447939052142762, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999052736760479, 2.000094726323952, 0, 1, 0.3333017578920159, 0, 0.4999763195405935, 2.168240058555778, 0.6666982421079841, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9987951598455929, 2.001204840154407, 0, 1, 0.3329317199485309, 0, 0.4996989713071266, 2.167037286491443, 0.6670682800514691, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809186920146, 2.004593732601037, 1, 0, 0.3148268445655524, 1.085680942582173, 0, -4.70825680840298, 1, 0.3148268445655524, 0.2305908506614428],
[0.9996070904751088, 2.000392909524891, 0, 1, 0.3332023634917029, 0, 0.4999017919122238, 2.167916855669992, 0.666797636508297, 1, 0.2305908506614428],
[0.6739141256190869, 2.32386104627124, 0, 1, 0.2248047591888395, 0, 0.430318328027639, 1.866155256348134, 0.7751952408111605, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992124856715845, 2.000787514328415, 0, 1, 0.3330708285571948, 0, 0.4998031989097354, 2.167489288825056, 0.6669291714428052, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950256, 2.325839083904972, 1, 0, 0.2247203053650087, 1.48332538437907, 0, -6.432715695892516, 1, 0.2247203053650086, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920713751110427, 1.07889342406735, 1, 0, 0.6403217617975568, 0.5206397879027355, 0, -2.25785102231635, 1, 0.6403217617975568, 0.2305908506614428],
[0.6741609012211044, 2.261953286690342, 1, 0, 0.2296099054991648, 1.483325417105479, 0, -6.432715837816657, 1, 0.2296099054991648, 0.2305908506614428],
[0.5049470890614834, 2.007787464473951, 0, 1, 0.2009552056945368, 0, 0.4980606850546326, 2.159932554244719, 0.7990447943054632, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[1.364902737443219, 1.310457018516044, 1, 1, 0.510175401421416, 0.7326529375076448, 0.763092559214491, 0.1320070662800848, 0.739721059784497, 0.7600718626273291, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.177177810801092, 1.759025886067147, 0, 1, 0.4009183055169749, 0, 0.5684964660956826, 2.465390385025979, 0.5990816944830251, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3078308691796601, 2.691776530104748, 0, 2, 0.1026237197751602, 0, 0.7430037291848191, 3.222173503647415, 0.8052841883101702, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.0000896275375, 1.9999103724625, 15, 0, 0.3333632091791668, 14.99865570742313, 0, -65.04445282369159, 1.000000000000001, 6.978547129055102e-08, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.00044418039713, 1.999163220774955, 0, 1, 0.3335250406457226, 0, 0.50020928236783, 2.169250345072213, 0.6664749593542774, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043567075961201, 2.006010373368273, 1, 1, 0.2009095448313337, 1.98272370514557, 0.4985019087019523, -6.436603153100711, 0.9596353547956663, 0.3614544444583337, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6952927021526817, 2.140015101429379, 0, 1, 0.2452265328209746, 0, 0.46728642210612, 2.026474254142014, 0.7547734671790254, 1, 0.2305908506614428],
[0.921081063834194, 2.078918936165806, 1, 0, 0.3070270212780647, 1.085680771502662, 0, -4.708256066484942, 1, 0.3070270212780647, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.00064231661682, 1.999126916289079, 1, 1, 0.3335730981037799, 0.9993580956889855, 0.5002183662537398, -2.164612030371017, 0.8887289882214461, 0.5558751844290057, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333420178032, 1.919156374656008, 1, 1, 0.342864892713975, 0.9986683554636625, 0.5210622819514856, -2.071227336827018, 0.8824436653442345, 0.5681734507721845, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9999053451777401, 2.00009465482226, 2, 1, 0.3333017817259133, 2.000189327565287, 0.499976337414324, -6.505951931083334, 0.9629734791699635, 0.2592171914449329, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991624871222781, 2.000837512877722, 0, 1, 0.3330541623740927, 0, 0.4997907094223465, 2.167435125846113, 0.6669458376259073, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.5043313629290652, 2.006627026089789, 0, 1, 0.2008521388226311, 0, 0.4983487150318355, 2.161181649672298, 0.7991478611773688, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905314441802, 0, 2, 0.3333438542829715, 0, 1.000047345020544, 4.336890826986146, 0.4444304166222839, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033867891, 2.325839096613208, 1, 0, 0.2247203011289299, 1.483325412340421, 0, -6.432715817152102, 1, 0.2247203011289299, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921384253129991, 1, 0, 0.3423034812789839, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3423034812789838, 0.2305908506614428],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.168342753260875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2305908506614428],
[0.9958119975606438, 2.004188002439356, 1, 1, 0.3319373325202146, 1.004205615567612, 0.498955187229377, -2.191112209738331, 0.8898176072793645, 0.5536922723197937, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000392826727628, 0, 1, 0.2519814424148225, 0, 0.4999018126034099, 2.167916945401159, 0.7480185575851775, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9980201139556942, 2.001592130007088, 0, 1, 0.3327163755796688, 0, 0.4996022841059325, 2.166617984507359, 0.6672836244203312, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.5044347710127651, 2.331075422462485, 0, 1, 0.177899121002461, 0, 0.4289865485963671, 1.860379747790653, 0.822100878997539, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.000315863028263, 0, 1, 0.2519886945196809, 0, 0.4999210467121466, 2.168000357681748, 0.748011305480319, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.9207828189775467, 2, 2, 0, 0.3152520663278474, 2.172064854794788, 0, -9.419562175013823, 1, 0.09938386532397736, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.505028259782623, 0.2962962962962963, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.920048309875481, 1.079165983063751, 2, 0, 0.640183768927639, 1.04164045754125, 0, -4.517267075225821, 1, 0.4098352579983966, 0.2305908506614428],
[0.999368162041738, 2.000631837958262, 1, 2, 0.3331227206805794, 1.000632237429869, 0.9996841807941502, -0.004111423471482706, 0.7410215132347053, 0.7034227981086438, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.917483328183062, 1.082516671816936, 0, 1, 0.6391611093943543, 0, 0.9237733016356808, 4.0061142885152, 0.3608388906056457, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9206116291664541, 2.079388370833545, 1, 0, 0.3068705430554847, 1.086234377579421, 0, -4.710656881934348, 1, 0.3068705430554848, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921568696494452, 0, 1, 0.342281871105713, 0, 0.5204081445666323, 2.256846458017989, 0.657718128894287, 1, 0.2305908506614428],
[0.9987951239237024, 2.001204876076297, 0, 1, 0.3329317079745675, 0, 0.4996989623374645, 2.16703724759284, 0.6670682920254325, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988218121183393, 2.00117818788166, 0, 1, 0.3329406040394465, 0, 0.4997056264432636, 2.167066147723872, 0.6670593959605535, 1, 0.2305908506614428],
[0.0008882530807573206, 2.999111746919239, 0, 1, 0.0002960843602524405, 0, 0.333432057350722, 1.445989970522605, 0.9997039156397476, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.3073872726197112, 2.692612727380289, 0, 1, 0.1024624242065704, 0, 0.3713864938063058, 1.610586425007736, 0.8975375757934296, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.002411590120526863, 2.997588409879469, 0, 1, 0.0008038633735089551, 0, 0.333601503363235, 1.446724804589207, 0.9991961366264911, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -8.673371013043498, 1, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[1, 1.509776817070658, 0, 0, 0.3984418029516951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996840574315479, 2.000315942568452, 0, 1, 0.3332280191438494, 0, 0.4999210268333796, 2.168000271473788, 0.6667719808561506, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.074248450506484, 1.925751549493513, 1, 0, 0.358082816835495, 0.930883353407233, 0, -4.03694834698351, 1, 0.358082816835495, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.261314204724325, 0, 1, 0.2295816534508691, 0, 0.4422207218752731, 1.917772195240082, 0.770418346549131, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.336685506521749, 0.4444444444444445, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9214738730760099, 2.07852612692399, 0, 1, 0.3071579576920033, 0, 0.4811101419638635, 2.086423379695308, 0.6928420423079966, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000214057157712, 1.999709037859662, 0, 1, 0.3334132327655283, 0, 0.5000727511189951, 2.168658251984203, 0.6665867672344717, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1.177177810745453, 1.759025886129838, 0, 1, 0.4009183054970628, 0, 0.5684964660754217, 2.465390384938114, 0.5990816945029371, 1, 0.2305908506614428],
[0.9992141896949132, 2.000785810305087, 0, 1, 0.333071396564971, 0, 0.4998036245806424, 2.167491134825909, 0.666928603435029, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.504090591878956, 2.331415562124455, 0, 1, 0.1777779925348558, 0, 0.4289239620107753, 1.860108329452014, 0.8222220074651442, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6948937778870524, 2.140414025695008, 1, 0, 0.2450858340703398, 1.439068864655368, 0, -6.240789088237642, 1, 0.2450858340703398, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.325744303564282, 0, 1, 0.2246503513911253, 0, 0.4299698803808597, 1.864644148488564, 0.7753496486088747, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9208083291340963, 2.078600821074217, 1, 2, 0.3069965726650347, 1.086002339857605, 0.9621857067132322, -0.5369537984235212, 0.7751262610000447, 0.6671825050530094, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001333218429481, 1.919151553704423, 0, 1, 0.3428654132984364, 0, 0.5210635908715807, 2.259688922508962, 0.6571345867015636, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.004282949589627, 0, 0, 0.3149301187299771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.003868768022784227, 2.996131231977212, 0, 2, 0.001289589340928077, 0, 0.6675275030193375, 2.894856847548614, 0.9974224843588122, 1, 0.2305908506614428],
[0.6753391236314109, 2.324660876368587, 1, 1, 0.2251130412104705, 1.480737550969702, 0.4301702713567951, -4.555979895123274, 0.9493241186769729, 0.3995502010979141, 0.2305908506614428],
[0.6741609160951255, 2, 1, 0, 0.2521018507291444, 1.483325384378851, 0, -6.432715695891563, 1, 0.2521018507291444, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9988221594403961, 2.001177840559604, 1, 1, 0.3329407198134653, 1.001179229503943, 0.4997057131715804, -2.174732930183054, 0.8891504770900918, 0.5550319167170221, 0.2305908506614428],
[0.9954114093009908, 2.004588590699007, 1, 1, 0.3318038031003305, 1.004609742922508, 0.4988554781962999, -2.193297189699711, 0.889906236248157, 0.5535138424488182, 0.2305908506614428],
[0.9911949728818731, 2.008805027118127, 1, 3, 0.3303983242939577, 1.008883244325308, 1.493425175415785, 2.101305969862132, 0.5978102850858183, 0.7989675676669569, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950456, 2.325839083904952, 1, 0, 0.2247203053650154, 1.483325384379026, 0, -6.432715695892326, 1, 0.2247203053650153, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1.000444508633568, 1.920636410058445, 0, 1, 0.3424911998266525, 0, 0.5206607532602019, 2.257941942478214, 0.6575088001733475, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9260468849523193, 2.089151386465719, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6473687186696796, 2.367829552748355, 0, 0, 0.2147018737727071, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.390505884856328, 0, 0, 0.3344159289439092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.3064205888632906, 2.708777682554748, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333333333333333, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989918890865581, 0, -8.673371013043496, 1, 0.1111111111111109, 0.2294285448959845],
[1.00422456262443, 2.010973708793609, 0, 2, 0.3330542379729298, 0, 0.9945430868908814, 4.334870743053246, 0.4448166494858694, 1, 0.2294285448959845],
[0.839539548487548, 2.010132180945359, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.823846071882781, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.9254034658267191, 2.089794805591319, 2, 0, 0.3069129730535116, 2.161219483021148, 0, -9.420011289357976, 1, 0.09419557302854553, 0.2294285448959845],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9991625961535968, 2.000837403846403, 0, 1, 0.3330541987178656, 0, 0.4997907366573632, 2.167435243955815, 0.6669458012821343, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078526126923995, 0, 1, 0.3071360682775925, 0, 0.4811101419638624, 2.086423379695303, 0.6928639317224075, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 6, 0.3333333333333333, 1, 3, 8.673371013043498, 0.263374485596708, 0.9414723365340649, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[0, 1.992156482857105, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8350775253160704, 2.00042862868734, 1, 0, 0.2945073930229481, 1.197493609496325, 0, -5.193153180455128, 1, 0.2945073930229481, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.168342753260875, 0.6666666666666667, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 3, 1, 0.3333333333333333, 3, 0.5, -10.84171376630437, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5040735681535882, 1.575370411534826, 0, 1, 0.2424078614655053, 0, 0.6347713481718477, 2.752803705572123, 0.7575921385344947, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033869312, 2.325839096613066, 1, 0, 0.2247203011289773, 1.483325412340109, 0, -6.432715817150746, 0.9999999999999999, 0.2247203011289773, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921473872975555, 1, 0, 0.3422929806938469, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3422929806938468, 0.2305908506614428],
[0.5043567061616963, 2.331149398662964, 1, 1, 0.1778718463358358, 1.982723710784567, 0.4289729352282406, -6.738128469102048, 0.9683616062810809, 0.3241052989527523, 0.2305908506614428],
[0.7380467737969596, 2.261953226203038, 1, 0, 0.2460155912656534, 1.354927675999984, 0, -5.875895214894324, 1, 0.2460155912656534, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.510367201649412, 1, 0, 0.3983480979766467, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3983480979766467, 0.2305908506614428],
[1.921379095096921, 1.078620904903077, 0, 0, 0.6404596983656407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.001110019368573, 1.998889980631427, 0, 1, 0.3337033397895243, 0, 0.500277658945547, 2.169546872785784, 0.6662966602104756, 1, 0.2305908506614428],
[0.9996840551777112, 2.000315944822288, 0, 1, 0.3332280183925704, 0, 0.4999210262700984, 2.168000269031014, 0.6667719816074296, 1, 0.2305908506614428],
[0.6950983103849246, 1.384633322625419, 0, 1, 0.3342250025686211, 0, 0.7222128657888205, 3.132010067689915, 0.6657749974313789, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.6741609160950456, 2.325839083904952, 1, 0, 0.2247203053650154, 1.483325384379026, 0, -6.432715695892326, 1, 0.2247203053650153, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 1.574699146331629, 0, 0, 0.2424308142878724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.921379095096921, 0, 0, 0.3423040856554167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.814652876235265, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6747565801591237, 2.037583439747417, 1, 1, 0.2487728585674792, 1.482015929009801, 0.490777447682811, -4.298689555477387, 0.9381120648401651, 0.4356577819751234, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.6986455016093884, 1.823846071882781, 0, 0, 0.2769664362613409, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9949594454327904, 0, -4.336685506521748, 1, 0.3333333333333333, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4974797227163952, 2.168342753260874, 0.6666666666666667, 1, 0.2294285448959845],
[0.9257050513967047, 2.089493220021334, 1, 0, 0.3070129948573327, 1.080257689521299, 0, -4.708471171322876, 1, 0.3070129948573328, 0.2294285448959845],
[1.00506609047268, 2.010132180945359, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.273724839104528, 0, 0, 0.2295073866602612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[0.6772766367551224, 2.337921634662914, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2294285448959845],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.078620904903077, 0, 0, 0.3071263650323076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8340297564467517, 2.001674864241484, 0, 1, 0.2941172893544637, 0, 0.4995816342925106, 2.16652843276078, 0.7058827106455363, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 2.14018386274667, 0, 0, 0.2451670114818531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.000495442437606, 1.998326109193858, 0, 4, 0.3336295358732838, 0, 2.001675292934863, 8.680636231633295, 0.1971800432285939, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.3057132459258353, 2.694286754074165, 0, 1, 0.1019044153086118, 0, 0.3711557422341368, 1.609585728009103, 0.8980955846913883, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9213790950969227, 2.004282949589627, 0, 0, 0.3149301187299771, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.3048760591646087, 2.695123940835392, 0, 0, 0.1016253530548696, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.003032750789964437, 2.996967249210032, 0, 2, 0.001010916929988147, 0, 0.6673412932781224, 2.894049314462713, 0.9979791880930631, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.8353078035820659, 2, 0, 0, 0.2946092140425658, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9207825130978278, 2.079217486902172, 1, 0, 0.3069275043659426, 1.086032788172375, 0, -4.709782652074542, 1, 0.3069275043659426, 0.2305908506614428],
[0.99929124194083, 2.00070875805917, 0, 2, 0.3330970806469433, 0, 0.9996457465104228, 4.335149220547865, 0.4447595038416296, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2, 0, 0, 0.2520184619080931, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9210809187234005, 2.078919081276599, 1, 0, 0.3070269729078002, 1.085680942545178, 0, -4.708256808242545, 1, 0.3070269729078001, 0.2305908506614428],
[0.5039217585714469, 2.331386045010615, 0, 0, 0.177730882669883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.17778454548191, 1.758342246410755, 0, 0, 0.4011354512121375, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6955806350798546, 1.38304026982322, 0, 1, 0.3346356391582088, 0, 0.7230447455646537, 3.135617668656939, 0.6653643608417912, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.9990240661308644, 2.000975933869135, 0, 1, 0.3330080220436215, 0, 0.4997561355305138, 2.167285189750498, 0.6669919779563784, 1, 0.2305908506614428],
[0.6741609033867831, 2.325839096613215, 1, 0, 0.2247203011289279, 1.483325412340435, 0, -6.43271581715216, 1, 0.2247203011289278, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951661335156835, 1.815200965948696, 1, 1, 0.2769181183357632, 1.438505059132659, 0.5509031885499028, -3.84925016771783, 0.9233163557373802, 0.4771525924089066, 0.2305908506614428],
[0.7377359950177957, 2.262264004982202, 0, 0, 0.2459119983392655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.336685506521749, 1, 0.3333333333333333, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6447944899630274, 2.355007080797558, 0, 2, 0.2149457138258458, 0, 0.8492543467523972, 3.682949016911716, 0.6163102322404109, 1, 0.2305908506614428],
[0.673862786910462, 2.326137213089535, 0, 0, 0.2246209289701542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1, 1.999905338411757, 0, 2, 0.3333438516194751, 0, 1.000047333034431, 4.336890775006148, 0.4444304201735564, 1, 0.2305908506614428],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[1.368986727745853, 1.304876059164608, 0, 0, 0.5119883991233751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428],
[0.6951239408353908, 1.383496964067684, 0, 0, 0.3344159289439091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2305908506614428]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0005553153991095415,
"Nucleotide GTR":0.0005546725186111271,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.0005554673873781875,
"Nucleotide GTR":0.0005548243309251822,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.0005553501853148444,
"Nucleotide GTR":0.0005547072645449498,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0005553446407839529,
"Nucleotide GTR":0.0005547017264328799,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.0005554476647414843,
"Nucleotide GTR":0.0005548046311210864,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node143":{
"Global MG94xREV":0.0005554596331842042,
"Nucleotide GTR":0.000554816585708115,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0005553715227040915,
"Nucleotide GTR":0.0005547285772322138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.0005555101137701484,
"Nucleotide GTR":0.0005548670078534244,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node256":{
"Global MG94xREV":0.0005554673873214233,
"Nucleotide GTR":0.0005548243308684829,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.0005552394118214587,
"Nucleotide GTR":0.0005545966192924129,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"Global MG94xREV":0.0001760029570302874,
"Nucleotide GTR":0.0001757992009865697,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.0001819953934752114,
"Nucleotide GTR":0.0001817847000756511,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node380":{
"Global MG94xREV":0.0005554301656523966,
"Nucleotide GTR":0.0005547871522904376,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0005552607160069428,
"Nucleotide GTR":0.0005546178988143551,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node395":{
"Global MG94xREV":0.000555595078526979,
"Nucleotide GTR":0.000554951874247802,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node398":{
"Global MG94xREV":0.0005553894551468868,
"Nucleotide GTR":0.0005547464889148831,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.000449545515748905,
"Nucleotide GTR":0.0004490250834942118,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node407":{
"Global MG94xREV":0.0001057876766186888,
"Nucleotide GTR":0.0001056652077759737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node461":{
"Global MG94xREV":0.000462798104752266,
"Nucleotide GTR":0.0004622623301695236,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node464":{
"Global MG94xREV":0.0004634762362195322,
"Nucleotide GTR":0.0004629396765739294,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node476":{
"Global MG94xREV":0.000555331499809871,
"Nucleotide GTR":0.0005546886006719117,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node487":{
"Global MG94xREV":0.0004731988613756392,
"Nucleotide GTR":0.0004726510459893954,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node490":{
"Global MG94xREV":0.0004768913566201378,
"Nucleotide GTR":0.0004763392664862701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node493":{
"Global MG94xREV":0.0004769308816165886,
"Nucleotide GTR":0.0004763787457252111,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node496":{
"Global MG94xREV":0.0004632069682482123,
"Nucleotide GTR":0.0004626707203301933,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node499":{
"Global MG94xREV":0.0004632069671654999,
"Nucleotide GTR":0.000462670719248734,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node502":{
"Global MG94xREV":0.0004632069671674485,
"Nucleotide GTR":0.0004626707192506794,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.0004632069671674485,
"Nucleotide GTR":0.0004626707192506794,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node513":{
"Global MG94xREV":0.0002237795207283645,
"Nucleotide GTR":0.0002235204544571042,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node514":{
"Global MG94xREV":0.0002510115303943005,
"Nucleotide GTR":0.0002507209380245834,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.0004632075949190324,
"Nucleotide GTR":0.0004626713462755249,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0004632069634916608,
"Nucleotide GTR":0.000462670715579148,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.0004632069645763206,
"Nucleotide GTR":0.0004626707166625519,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node528":{
"Global MG94xREV":0.0004632069645743729,
"Nucleotide GTR":0.0004626707166606063,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.0004632069671674485,
"Nucleotide GTR":0.0004626707192506794,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.0004639559922145829,
"Nucleotide GTR":0.0004634188771624959,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node54":{
"Global MG94xREV":0.0005555101137588717,
"Nucleotide GTR":0.0005548670078421609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.0004624746017678244,
"Nucleotide GTR":0.0004619392016997453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.0004632069671674485,
"Nucleotide GTR":0.0004626707192506794,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.0005555409291510383,
"Nucleotide GTR":0.0005548977875598,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.0004639559922124692,
"Nucleotide GTR":0.0004634188771603845,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "V", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "GTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node556":{
"Global MG94xREV":0.0004632063345554032,
"Nucleotide GTR":0.0004626700873710005,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node562":{
"Global MG94xREV":0.0005554348051913349,
"Nucleotide GTR":0.0005547917864582492,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.0004639559922145829,
"Nucleotide GTR":0.0004634188771624959,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.0002812966606447634,
"Nucleotide GTR":0.0002809710076236379,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node579":{
"Global MG94xREV":0.000274149647016208,
"Nucleotide GTR":0.000273832267988008,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node594":{
"Global MG94xREV":0.0005554768958389287,
"Nucleotide GTR":0.0005548338283781175,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.0002366842773700248,
"Nucleotide GTR":0.0002364102714511423,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node600":{
"Global MG94xREV":0.0003186747082174198,
"Nucleotide GTR":0.0003183057831784609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node606":{
"Global MG94xREV":0.0005552819257250268,
"Nucleotide GTR":0.0005546390839782584,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.0005554789486818578,
"Nucleotide GTR":0.0005548358788444996,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.0005553611561284307,
"Nucleotide GTR":0.000554718222657786,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.0005554946737082099,
"Nucleotide GTR":0.0005548515856662199,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.0005555377851797115,
"Nucleotide GTR":0.0005548946472282026,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.0005551777885190134,
"Nucleotide GTR":0.0005545350673303619,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node667":{
"Global MG94xREV":0.0005554649229529651,
"Nucleotide GTR":0.0005548218693529883,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.0005552467819008582,
"Nucleotide GTR":0.0005546039808395793,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.000555303117605053,
"Nucleotide GTR":0.0005546602513247567,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node676":{
"Global MG94xREV":0.0005552503723296946,
"Nucleotide GTR":0.0005546075671118298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node679":{
"Global MG94xREV":0.0005554585418136157,
"Nucleotide GTR":0.0005548154956009901,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.0005545818026755786,
"Nucleotide GTR":0.0005539397714510027,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node685":{
"Global MG94xREV":0.0005552012975161785,
"Nucleotide GTR":0.0005545585491115065,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node688":{
"Global MG94xREV":0.0004810424629815433,
"Nucleotide GTR":0.0004804855671726817,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node689":{
"Global MG94xREV":7.412131609356205e-05,
"Nucleotide GTR":7.403550693230008e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node748":{
"Global MG94xREV":0.0005552677729909946,
"Nucleotide GTR":0.0005546249476286393,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node758":{
"Global MG94xREV":0.0005553712793402099,
"Nucleotide GTR":0.0005547283341500713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node76":{
"Global MG94xREV":0.0005554898532779007,
"Nucleotide GTR":0.0005548467708164524,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.00111107770685395,
"Nucleotide GTR":0.001109791428477545,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node767":{
"Global MG94xREV":0.0005554618102668969,
"Nucleotide GTR":0.0005548187602704312,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node782":{
"Global MG94xREV":0.0004745834763497002,
"Nucleotide GTR":0.0004740340580149946,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node791":{
"Global MG94xREV":0.0005553684831416423,
"Nucleotide GTR":0.0005547255411886219,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node792":{
"Global MG94xREV":0.0005553895570536849,
"Nucleotide GTR":0.0005547465907037055,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node797":{
"Global MG94xREV":0.0005549799814143922,
"Nucleotide GTR":0.0005543374892241269,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.0005552259629362498,
"Nucleotide GTR":0.0005545831859767816,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":0.000238706889437675,
"Nucleotide GTR":0.000238430541970447,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node805":{
"Global MG94xREV":0.0003166756665944955,
"Nucleotide GTR":0.0003163090558167237,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node809":{
"Global MG94xREV":0.0003789922321996802,
"Nucleotide GTR":0.0003785534784472677,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node810":{
"Global MG94xREV":0.0001764029564083005,
"Nucleotide GTR":0.0001761987372911655,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node814":{
"Global MG94xREV":0.0003965721262535662,
"Nucleotide GTR":0.000396113020515472,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node815":{
"Global MG94xREV":0.0001588742361793284,
"Nucleotide GTR":0.0001586903098046878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node824":{
"Global MG94xREV":0.0005555864067407712,
"Nucleotide GTR":0.0005549432125007942,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node828":{
"Global MG94xREV":0.0004149784183046178,
"Nucleotide GTR":0.000414498003871993,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node829":{
"Global MG94xREV":0.0001402911907074352,
"Nucleotide GTR":0.00014012877765217,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node834":{
"Global MG94xREV":0.0005555508069279954,
"Nucleotide GTR":0.0005549076539013991,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node839":{
"Global MG94xREV":0.000383342772630941,
"Nucleotide GTR":0.0003828989823216359,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.0001720310692428251,
"Nucleotide GTR":0.0001718319113953838,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0005553469329656031,
"Nucleotide GTR":0.0005547040159609044,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node847":{
"Global MG94xREV":0.0005555019404593493,
"Nucleotide GTR":0.0005548588440047486,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node854":{
"Global MG94xREV":0.0005553490116627893,
"Nucleotide GTR":0.0005547060922516144,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node857":{
"Global MG94xREV":0.0005558790718264308,
"Nucleotide GTR":0.0005552355387723738,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node863":{
"Global MG94xREV":0.0005553537602853968,
"Nucleotide GTR":0.0005547108353768109,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node867":{
"Global MG94xREV":0.0004794276741451905,
"Nucleotide GTR":0.000478872647753698,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node873":{
"Global MG94xREV":0.0004794029372801319,
"Nucleotide GTR":0.0004788479395261453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node878":{
"Global MG94xREV":0.0005553965154893533,
"Nucleotide GTR":0.0005547535410836945,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node884":{
"Global MG94xREV":0.000479484727552507,
"Nucleotide GTR":0.0004789296351111204,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node892":{
"Global MG94xREV":0.0004794847274531345,
"Nucleotide GTR":0.0004789296350118627,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "L", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CTT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node900":{
"Global MG94xREV":0.0003460066739106921,
"Nucleotide GTR":0.0003456061070556487,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node903":{
"Global MG94xREV":0.0005553112836794161,
"Nucleotide GTR":0.0005546684079453737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node913":{
"Global MG94xREV":0.000478688899644126,
"Nucleotide GTR":0.0004781347285210445,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node932":{
"Global MG94xREV":0.000479485508561275,
"Nucleotide GTR":0.000478930415215726,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node953":{
"Global MG94xREV":0.0005554730865050015,
"Nucleotide GTR":0.0005548300234542003,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node956":{
"Global MG94xREV":0.0005553508761483723,
"Nucleotide GTR":0.0005547079545787087,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node960":{
"Global MG94xREV":0.0005554278026900018,
"Nucleotide GTR":0.0005547847920636101,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node963":{
"Global MG94xREV":0.0004434498988285302,
"Nucleotide GTR":0.0004429365233802027,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":9.213938728508696e-05,
"Nucleotide GTR":9.203271886689356e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406036_California_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACG", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555496723140319,
"Nucleotide GTR":0.0005549065206009623,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "T", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "ACT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":9.214002526585796e-05,
"Nucleotide GTR":9.203335610908354e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162305765458296,
"Nucleotide GTR":0.001160960181109282,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "ILVF", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-TT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559567569260764,
"Nucleotide GTR":0.0005553131339371177,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCT", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413749_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005563573276054347,
"Nucleotide GTR":0.0005557132408816709,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "E", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "HPRL", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAA", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CNT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551542812476962,
"Nucleotide GTR":0.0005545115872730691,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413931_California_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553769327911654,
"Nucleotide GTR":0.0005547339810561094,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "A", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GCA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCG", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "TPAS", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "NCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415149_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556176298501161,
"Nucleotide GTR":0.0005549743994636022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "S", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "TCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553415173501674,
"Nucleotide GTR":0.000554698606615048,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTC", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111359901358742,
"Nucleotide GTR":0.001110073296289892,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "H", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "CAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556707755684321,
"Nucleotide GTR":0.0005550274836558999,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "T", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "ACA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "I", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "ATC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556667897517332,
"Nucleotide GTR":0.0005550235024535224,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "ACT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556378828691517,
"Nucleotide GTR":0.0005549946290360149,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "I", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "ATT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554435419429481,
"Nucleotide GTR":0.0005548005130954533,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "RG", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "NGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111446358809112,
"Nucleotide GTR":0.001110159653649741,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "P", "I", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "CCA", "ATA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555221715379196,
"Nucleotide GTR":0.0005548790516620952,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "K", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "AAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618102613063,
"Nucleotide GTR":0.0005548187602648471,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553344460521285,
"Nucleotide GTR":0.0005546915435033479,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "T", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "ACT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":8.06444577776325e-05,
"Nucleotide GTR":8.055109687085118e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553940304522529,
"Nucleotide GTR":0.0005547510589234858,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGC", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "ILV", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "NTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555860044177617,
"Nucleotide GTR":0.0005549428106435477,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "V", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GTT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417231_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "IM", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATN", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "KTRI", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ANA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417261_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618102645038,
"Nucleotide GTR":0.0005548187602680416,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "F", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TTT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417324_California_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554739103041332,
"Nucleotide GTR":0.0005548308462996318,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "R", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AGA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "QPRL", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CNG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTG", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554015087588116,
"Nucleotide GTR":0.0005547585285725175,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556541546165754,
"Nucleotide GTR":0.0005550108819458759,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "I", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "ATT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAG", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTN", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTN", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555776574806229,
"Nucleotide GTR":0.0005549344733695353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "TTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554699035383493,
"Nucleotide GTR":0.0005548268441724222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "P", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "CCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554995256854142,
"Nucleotide GTR":0.0005548564320263609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553747991628765,
"Nucleotide GTR":0.0005547318498978901,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00111138439654859,
"Nucleotide GTR":0.001110097763122019,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "Q", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAG", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555862031590382,
"Nucleotide GTR":0.0005549430091547444,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "H", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAC", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554174860146608,
"Nucleotide GTR":0.0005547744873317328,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "V", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "GTC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "DAGV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GNT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556543427496656,
"Nucleotide GTR":0.0005550110698611656,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555590126588173,
"Nucleotide GTR":0.0005549469280417828,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "KTRI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ANA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418732_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555776574806229,
"Nucleotide GTR":0.0005549344733695353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAT", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552161350462654,
"Nucleotide GTR":0.0005545733694644017,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555775403496881,
"Nucleotide GTR":0.0005549343563742015,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "F", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "TTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555227580253764,
"Nucleotide GTR":0.0005548796374705837,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555061359821627,
"Nucleotide GTR":0.0005548630346704658,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553698356948083,
"Nucleotide GTR":0.0005547268921759563,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGC", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552665517173837,
"Nucleotide GTR":0.0005546237277688785,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCG", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553226989291138,
"Nucleotide GTR":0.0005546798099798043,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "G", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GGG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005559573461408557,
"Nucleotide GTR":0.0005553137224697712,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "V", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GTT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "ILV", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "NTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "IM", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATN", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556667987501664,
"Nucleotide GTR":0.0005550235114415386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "M", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "ATG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "ED", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAN", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "D", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAT", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552905785617186,
"Nucleotide GTR":0.0005546477267976878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAC", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555409401037276,
"Nucleotide GTR":0.0005547664117142064,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "R", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CGA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552430157340665,
"Nucleotide GTR":0.0005546002190328247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556026000850723,
"Nucleotide GTR":0.0005549593870982973,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGT", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175340027,
"Nucleotide GTR":0.0005548424400919814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTC", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556025992407542,
"Nucleotide GTR":0.0005549593862549568,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "S", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "TCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556025987919047,
"Nucleotide GTR":0.0005549593858066271,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553297054365637,
"Nucleotide GTR":0.0005546868083759235,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055618526043223,
"Nucleotide GTR":0.0005555413729081118,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "H", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CAC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556024112627105,
"Nucleotide GTR":0.0005549591984945326,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "I", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ATA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "TPAS", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "NCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":7.271047767915134e-07,
"Nucleotide GTR":7.262630182484344e-07,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005667452210951124,
"Nucleotide GTR":0.0005660891084593091,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "N", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAC", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACN", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551967958419893,
"Nucleotide GTR":0.000554554052648839,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "R", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AGA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420542_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "KQE", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "-", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "NAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "---", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420542_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "TPAS", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "NCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420634_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005557008672273207,
"Nucleotide GTR":0.0005550575404781152,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "I", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "ATC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "ILVF", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "NTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "DAGV", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GNT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "TPAS", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "NCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "YSCF", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TNC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555433631729556,
"Nucleotide GTR":0.0005547906143549701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGG", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "HPRL", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CNT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855177202657,
"Nucleotide GTR":0.0005548424402780286,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAC", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556803618233823,
"Nucleotide GTR":0.0005550370588129827,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "S", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "AGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553659638966199,
"Nucleotide GTR":0.0005547230248600917,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005561858220865329,
"Nucleotide GTR":0.0005555419339121956,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "I", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552296700042045,
"Nucleotide GTR":0.0005545868887531189,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556024104717835,
"Nucleotide GTR":0.0005549591977045209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "L", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CTT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554336317421413,
"Nucleotide GTR":0.0005547906143675406,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "R", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AGG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556024112627105,
"Nucleotide GTR":0.0005549591984945326,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "V", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GTT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "S", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "TCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCN", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "ILVF", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "NTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554336315987333,
"Nucleotide GTR":0.0005547906142242983,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "A", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "GCT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421864_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "SL", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TNA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "HPRL", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CNT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421880_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCN", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QPRL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CNA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "ILVF", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "NTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421915_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "DAGV", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GNT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421931_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556164009611207,
"Nucleotide GTR":0.0005549731719972732,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "H", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YSCF", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "CAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TNT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421939_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556364815663643,
"Nucleotide GTR":0.0005549932293554956,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "Y", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "TAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "ILV", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "NTA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422003_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTN", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "I", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATT", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175712375,
"Nucleotide GTR":0.0005548424401291731,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAC", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552256445258485,
"Nucleotide GTR":0.0005545828679349994,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTN", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005562888386168968,
"Nucleotide GTR":0.0005556448311818316,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "NHDY", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "T", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "NAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "ACT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACN", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552745568188016,
"Nucleotide GTR":0.0005546317236029095,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553617865854827,
"Nucleotide GTR":0.0005547188523849673,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "NTSI", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "ANT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "TPAS", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "NCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCN", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559573461408557,
"Nucleotide GTR":0.0005553137224697712,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCT", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "HPRL", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CNT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAN", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "DAGV", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GNT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554178542131598,
"Nucleotide GTR":0.0005547748551039735,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "F", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "TTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552959073840321,
"Nucleotide GTR":0.0005546530494509024,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "S", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "TCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552844444071551,
"Nucleotide GTR":0.0005546415997445458,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555191180202036,
"Nucleotide GTR":0.000554876001679392,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556025993049479,
"Nucleotide GTR":0.000554959386319076,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "Y", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555705445778651,
"Nucleotide GTR":0.0005549273687012815,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554853415448106,
"Nucleotide GTR":0.0005548422643065302,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555449692372271,
"Nucleotide GTR":0.0005548066564045138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "ILVF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "NTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423061_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "ILVF", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "NTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423062_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555482475424546,
"Nucleotide GTR":0.0005548394015043298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTN", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTN", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423112_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553212124155475,
"Nucleotide GTR":0.0005546783251871536,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423121_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "SRGC", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "NGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423145_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554854006487144,
"Nucleotide GTR":0.0005548423233420091,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGC", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423147_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "DAGV", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GNT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "ILVF", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "NTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "MLV", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "NTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423282_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "ILV", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "NTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423312_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558645606916162,
"Nucleotide GTR":0.0005552210444368868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "I", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "ATA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423339_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "QH", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAN", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "MLV", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "NTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423385_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005557004187918396,
"Nucleotide GTR":0.0005550570925617824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "Y", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TAT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTN", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423404_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "EAGV", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GNA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423409_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QPRL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CNA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QPRL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CNA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTN", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "NHDY", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "NAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005567255410983363,
"Nucleotide GTR":0.0005560810280992093,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "TPAS", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "NCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCA", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "ILVF", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "NTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423570_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "NTSI", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "ANT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423593_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175712375,
"Nucleotide GTR":0.0005548424401291731,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAC", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423598_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGN", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423656_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "ED", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAN", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "KN", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAN", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "TPAS", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "NCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423709_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553246961714765,
"Nucleotide GTR":0.0005546818049099886,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423736_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "RS", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGN", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423743_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175712375,
"Nucleotide GTR":0.0005548424401291731,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCC", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423758_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555973887458151,
"Nucleotide GTR":0.0005549541817921318,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423779_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCN", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556182642458993,
"Nucleotide GTR":0.000554975033124955,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423870_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTN", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423888_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553717158904792,
"Nucleotide GTR":0.0005547287701949525,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAT", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423907_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAN", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423954_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":9.252114424820738e-05,
"Nucleotide GTR":9.241403387557304e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "KQE", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "NAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "ED", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAN", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424026_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":9.17770004444551e-05,
"Nucleotide GTR":9.167075155619566e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424088_England_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "QPRL", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CNA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "ILV", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "NTA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553132697065267,
"Nucleotide GTR":0.0005546703916732909,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "D", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAC", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424144_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "KTRI", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ANA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175340027,
"Nucleotide GTR":0.0005548424400919814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAC", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "RGW", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "NGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551554843117387,
"Nucleotide GTR":0.0005545127889443417,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAG", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551514477548913,
"Nucleotide GTR":0.0005545087570605568,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "A", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "GCA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553030658857172,
"Nucleotide GTR":0.0005546601996652949,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTT", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00055532269947242,
"Nucleotide GTR":0.0005546798105224821,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "A", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "C", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "TGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618390708692,
"Nucleotide GTR":0.0005548187890410575,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCC", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005550857162922876,
"Nucleotide GTR":0.0005544431016943042,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552745588167536,
"Nucleotide GTR":0.0005546317255985473,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACT", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552614497476221,
"Nucleotide GTR":0.0005546186317055923,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552959182378329,
"Nucleotide GTR":0.000554653060292138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "N", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAT", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "HPRL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CNT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551595187699849,
"Nucleotide GTR":0.0005545168187319539,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "R", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AGG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552006282204217,
"Nucleotide GTR":0.0005545578805905831,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "KTRI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ANA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QPRL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CNA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "ILVF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "NTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855175340027,
"Nucleotide GTR":0.0005548424400919814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTC", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":9.285582017924411e-05,
"Nucleotide GTR":9.27483223571898e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554644541540603,
"Nucleotide GTR":0.0005548214010968047,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555130033778827,
"Nucleotide GTR":0.0005548698941159032,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553977329719376,
"Nucleotide GTR":0.0005547547571568168,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552150668020542,
"Nucleotide GTR":0.0005545723024568812,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACT", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425255_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618391874846,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891575381,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTC", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425259_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554618391986052,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891686459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425435_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "S", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "TCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556025988044274,
"Nucleotide GTR":0.000554959385819135,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCT", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554395042848172,
"Nucleotide GTR":0.0005547964801116595,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001670189162536517,
"Nucleotide GTR":0.00166825560902264,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "I", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "Y", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCG", "ATA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TAT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556024712497937,
"Nucleotide GTR":0.0005549592584121695,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATT", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552990958882642,
"Nucleotide GTR":0.0005546562342638495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552117849055502,
"Nucleotide GTR":0.0005545690243597809,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554819669096104,
"Nucleotide GTR":0.000554838893578095,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555901282832061,
"Nucleotide GTR":0.0005549469297348537,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554174859159596,
"Nucleotide GTR":0.0005547744872331455,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCG", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "DAGV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GNT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552349215777377,
"Nucleotide GTR":0.0005545921342469818,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "F", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "TTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554496924000088,
"Nucleotide GTR":0.0005548066564322194,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555021417598204,
"Nucleotide GTR":0.0005548590450721767,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":8.2113119399976e-05,
"Nucleotide GTR":8.201805824516038e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556110053317355,
"Nucleotide GTR":0.0005549677826143299,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATA", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555775321435316,
"Nucleotide GTR":0.0005549343481775456,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTT", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559567569260764,
"Nucleotide GTR":0.0005553131339371177,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCT", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002093167902014573,
"Nucleotide GTR":0.0002090744672213508,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001118820790519829,
"Nucleotide GTR":0.0001117525548088952,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555457803880097,
"Nucleotide GTR":0.000554814758521767,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "T", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ACA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555734417777794,
"Nucleotide GTR":0.0005549302625471497,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAT", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "SRGC", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "NGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554578040316878,
"Nucleotide GTR":0.000554814758673181,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACC", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "DAGV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GNT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGT", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "DAGV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GNT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551632507060876,
"Nucleotide GTR":0.0005545205463476504,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "L", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "TTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":9.213938712231491e-05,
"Nucleotide GTR":9.203271870430989e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554560026210783,
"Nucleotide GTR":0.0005548129593480392,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "G", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "GGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554578038841607,
"Nucleotide GTR":0.0005548147585258253,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGC", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555435640936573,
"Nucleotide GTR":0.0005547926212359573,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055540535580907,
"Nucleotide GTR":0.0005547623711691027,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554769844063478,
"Nucleotide GTR":0.0005548339168430039,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "L", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "TTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555852571720137,
"Nucleotide GTR":0.0005549420642628757,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAA", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555776572943883,
"Nucleotide GTR":0.0005549344731835171,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "L", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CTA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "NHDY", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "NAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557088504503228,
"Nucleotide GTR":0.0005550655144590581,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTA", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCG", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555531818885505,
"Nucleotide GTR":0.0005549100261124974,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAA", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555957346170339,
"Nucleotide GTR":0.0005553137224992211,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "V", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GTC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555409401030367,
"Nucleotide GTR":0.0005547664117073062,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "A", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552740471435397,
"Nucleotide GTR":0.0005546312145176904,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554618390567873,
"Nucleotide GTR":0.0005548187890269916,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACC", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "S", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "TCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000555433631729556,
"Nucleotide GTR":0.0005547906143549701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "C", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TGT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556024112614198,
"Nucleotide GTR":0.0005549591984932436,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "I", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ATA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555776574917911,
"Nucleotide GTR":0.0005549344733806912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "C", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "TGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556323844420768,
"Nucleotide GTR":0.0005549891369743882,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTA", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "ED", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAN", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555274556795432,
"Nucleotide GTR":0.0005546317235795657,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "I", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATT", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0005555735002557171,
"Nucleotide GTR":0.0005549303209573876,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "L", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TTA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555733311365753,
"Nucleotide GTR":0.000554930152034033,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "V", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GTC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558470542497018,
"Nucleotide GTR":0.0005552035582619247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "E", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAA", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429001_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556502322315769,
"Nucleotide GTR":0.0005550069641017643,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "M", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "ATG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429011_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554644032464625,
"Nucleotide GTR":0.0005548213502481429,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "F", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "TTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429041_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552214348395948,
"Nucleotide GTR":0.0005545786631222374,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "TTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429061_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554053558074996,
"Nucleotide GTR":0.0005547623711675343,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "G", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "QPRL", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CNG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554578040130566,
"Nucleotide GTR":0.0005548147586545726,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGC", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "IM", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATN", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554336316113185,
"Nucleotide GTR":0.0005547906142368692,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "A", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "GCT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556499943930002,
"Nucleotide GTR":0.0005550067265385298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "I", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "ATA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00055541521525467,
"Nucleotide GTR":0.0005547722192005673,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "S", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "TCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001112181234678041,
"Nucleotide GTR":0.001110893678763646,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "T", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "V", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "ACA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "GTG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554815701922888,
"Nucleotide GTR":0.000554838497320046,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005561858242558915,
"Nucleotide GTR":0.0005555419360790422,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "D", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GAC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":{
"Global MG94xREV":0.000555602599302923,
"Nucleotide GTR":0.0005549593863170537,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCT", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555409083694843,
"Nucleotide GTR":0.0005548977668023046,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554855174017367,
"Nucleotide GTR":0.0005548424399598686,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGC", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556026000850723,
"Nucleotide GTR":0.0005549593870982973,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "L", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CTA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552353481373434,
"Nucleotide GTR":0.000554592560312766,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555296518076105,
"Nucleotide GTR":0.0005548865232719869,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "N", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "AAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552822945524,
"Nucleotide GTR":0.0005546394523786458,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552693013038378,
"Nucleotide GTR":0.0005546264741721772,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553212298479675,
"Nucleotide GTR":0.0005546783425993914,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACC", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554336315959765,
"Nucleotide GTR":0.0005547906142215454,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "V", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "GTA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556803623052874,
"Nucleotide GTR":0.0005550370592943298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "T", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "ACA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555998767471024,
"Nucleotide GTR":0.0005549566669130955,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556025992407542,
"Nucleotide GTR":0.0005549593862549568,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":9.213938768975218e-05,
"Nucleotide GTR":9.203271927109028e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555189491597179,
"Nucleotide GTR":0.000554546756860046,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACC", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555862028041344,
"Nucleotide GTR":0.0005549430088002517,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "A", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GCA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "QH", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAN", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGN", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "KTRI", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ANA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "ILV", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "NTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "ILVF", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "NTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "LF", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTN", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "ILVF", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "NTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111648074325117,
"Nucleotide GTR":0.00111036113564265,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "L", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TTA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "LF", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTN", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":7.581598723176314e-05,
"Nucleotide GTR":7.572821617456302e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "L", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CTT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "SL", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TNA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554855174497603,
"Nucleotide GTR":0.0005548424400078364,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "H", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "CAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "TPAS", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "NCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "NTSI", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ANT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555957348005022,
"Nucleotide GTR":0.0005553137243317799,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "H", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAT", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "ILVF", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "NTT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "YSCF", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TNT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "KQE", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "NAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "KN", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAN", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTN", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "HPRL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CNT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "ILVF", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "NTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556025987919047,
"Nucleotide GTR":0.0005549593858066271,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "F", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TTT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556025992407542,
"Nucleotide GTR":0.0005549593862549568,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAT", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "NHDY", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "NAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "L", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "TTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":7.590028863961505e-05,
"Nucleotide GTR":7.58124199879106e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":{
"Global MG94xREV":9.213939166568673e-05,
"Nucleotide GTR":9.20327232424219e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "F", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTN", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGN", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "KTRM", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ANG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":7.587407110075193e-05,
"Nucleotide GTR":7.578623280070796e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTN", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559573461408557,
"Nucleotide GTR":0.0005553137224697712,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "Y", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "TAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556543432654705,
"Nucleotide GTR":0.0005550110703763745,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "T", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "ACA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":9.127337239775637e-05,
"Nucleotide GTR":9.116770655230497e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "TPAS", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "NCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556483494881582,
"Nucleotide GTR":0.0005550050835379701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555787775782344,
"Nucleotide GTR":0.0005549355921704268,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555734417777794,
"Nucleotide GTR":0.0005549302625471497,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "V", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GTA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618391986052,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891686459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "A", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTN", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGN", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555735002557171,
"Nucleotide GTR":0.0005549303209573876,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005553048710789017,
"Nucleotide GTR":0.0005546620027686342,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":9.213938981536108e-05,
"Nucleotide GTR":9.203272139423837e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":7.723763124581473e-05,
"Nucleotide GTR":7.714821437217623e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005554578038856568,
"Nucleotide GTR":0.0005548147585273199,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTC", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432456_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432466_England_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005553876634978208,
"Nucleotide GTR":0.0005547446993399828,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432466_England_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553986181400587,
"Nucleotide GTR":0.0005547556413001926,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACG", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432548_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432559_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553271991007588,
"Nucleotide GTR":0.0005546843049416675,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432559_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432566_England_20200403_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0005555735002557171,
"Nucleotide GTR":0.0005549303209573876,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGT", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432566_England_20200403_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432619_England_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":7.838792467668707e-05,
"Nucleotide GTR":7.829717612520336e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432619_England_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432847_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "F", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTT", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432847_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552959182378329,
"Nucleotide GTR":0.000554653060292138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555659344509957,
"Nucleotide GTR":0.0005549227639114883,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATC", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551659200198466,
"Nucleotide GTR":0.0005545232125711832,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "L", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "TTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555433631729556,
"Nucleotide GTR":0.0005547906143549701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "A", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "GCT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001111530824568323,
"Nucleotide GTR":0.001110244021624181,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005555774635455052,
"Nucleotide GTR":0.0005549342796589335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "I", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ATT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558772098246158,
"Nucleotide GTR":0.0005552336789261703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTA", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554053556110255,
"Nucleotide GTR":0.0005547623709712883,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCG", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGN", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":8.048275344738785e-05,
"Nucleotide GTR":8.038957974333962e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0005556025988011194,
"Nucleotide GTR":0.0005549593858158314,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":9.127337436547862e-05,
"Nucleotide GTR":9.116770851774923e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555735002557171,
"Nucleotide GTR":0.0005549303209573876,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "I", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ATT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111415271448382,
"Nucleotide GTR":0.001110128602278392,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "S", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "A", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "TCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GCC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555496753329713,
"Nucleotide GTR":0.000554906523616406,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAA", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005556213813739458,
"Nucleotide GTR":0.0005549781466443482,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCA", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00055521546289574,
"Nucleotide GTR":0.0005545726980920155,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433673_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "L", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "TTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433687_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553226993871776,
"Nucleotide GTR":0.0005546798104373393,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "V", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "GTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433741_England_20200326_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0005552230866775041,
"Nucleotide GTR":0.0005545803130478389,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433741_England_20200326_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":7.581519689230764e-05,
"Nucleotide GTR":7.572742675007194e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433771_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433804_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555735002571021,
"Nucleotide GTR":0.0005549303209587708,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGT", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433809_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433832_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553867525559949,
"Nucleotide GTR":0.0005547437894527403,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433832_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555367877880637,
"Nucleotide GTR":0.0005547249366283185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433853_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433866_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094010246092,
"Nucleotide GTR":0.0005547664117015554,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "S", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AGC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433888_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433895_England_20200410_null_49":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433895_England_20200410_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433900_England_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556269684441971,
"Nucleotide GTR":0.0005549837272465302,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433900_England_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433902_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552695990625394,
"Nucleotide GTR":0.0005546267715861673,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "S", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "TCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433902_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555792729203302,
"Nucleotide GTR":0.0005549360869390731,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433904_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555802808071971,
"Nucleotide GTR":0.0005551593633073439,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433908_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556822944319406,
"Nucleotide GTR":0.0005550389891841887,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433922_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553985064105052,
"Nucleotide GTR":0.0005547555296999858,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433981_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434004_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434004_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555409401037276,
"Nucleotide GTR":0.0005547664117142064,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACG", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001973933391558065,
"Nucleotide GTR":0.0001971648197802161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434013_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550903996224672,
"Nucleotide GTR":0.0005544477796026609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "R", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CGT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554936682909325,
"Nucleotide GTR":0.0005548505814129,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGT", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552546062128689,
"Nucleotide GTR":0.0005546117960934996,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555186061767025,
"Nucleotide GTR":0.0005548754904284444,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555325291406555,
"Nucleotide GTR":0.0005546823994559744,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTC", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111192831949263,
"Nucleotide GTR":0.001109906420294222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "F", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "I", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "TTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "ATA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556543445785046,
"Nucleotide GTR":0.0005550110716878881,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "I", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "ATA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":9.213938716170292e-05,
"Nucleotide GTR":9.20327187436523e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555860044177617,
"Nucleotide GTR":0.0005549428106435477,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGT", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554556134903032,
"Nucleotide GTR":0.0005548125706677548,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556543432220512,
"Nucleotide GTR":0.0005550110703330053,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAA", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0005552858878987155,
"Nucleotide GTR":0.0005546430415649971,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "N", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAT", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553213233001295,
"Nucleotide GTR":0.0005546784359433665,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTT", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001113602444671284,
"Nucleotide GTR":0.001112313243442911,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "Q", "A", "A", "D", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAA", "GCC", "GCT", "GAT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553492965555406,
"Nucleotide GTR":0.0005547063768145493,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAG", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":7.845437245776999e-05,
"Nucleotide GTR":7.836354698066391e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555409401030367,
"Nucleotide GTR":0.0005547664117073062,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTG", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":9.213938673014679e-05,
"Nucleotide GTR":9.203271831259577e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0005557971161970443,
"Nucleotide GTR":0.0005551536780218173,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATA", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618390693882,
"Nucleotide GTR":0.0005548187890395779,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAC", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555474211859809,
"Nucleotide GTR":0.0005549042720790094,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552695486627017,
"Nucleotide GTR":0.0005546267212446772,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "L", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CTT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "I", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "ATA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005552959182378329,
"Nucleotide GTR":0.000554653060292138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005552787805913678,
"Nucleotide GTR":0.0005546359424856745,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGG", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618393341495,
"Nucleotide GTR":0.0005548187893040325,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAC", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554766281183761,
"Nucleotide GTR":0.0005548335609675013,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "I", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055540940114453,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118213371,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "G", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GGT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554174860284007,
"Nucleotide GTR":0.0005547744873454565,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "G", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "GGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111648058778775,
"Nucleotide GTR":0.001110361120114305,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "D", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACG", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GAT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111578198172207,
"Nucleotide GTR":0.001110291340384338,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "V", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "N", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GTT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "AAT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCN", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554618392000862,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891701252,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "CAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "RS", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGN", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618392015607,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891715975,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTC", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555776574917911,
"Nucleotide GTR":0.0005549344733806912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGT", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001111574034604539,
"Nucleotide GTR":0.001110287181636771,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "D", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAT", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAT", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556543431565573,
"Nucleotide GTR":0.0005550110702675862,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "K", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AAG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553449999921616,
"Nucleotide GTR":0.0005547020852252396,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "DAGV", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GNC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9":{
"Global MG94xREV":9.213875773749451e-05,
"Nucleotide GTR":9.203209004811916e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005555901283124398,
"Nucleotide GTR":0.0005549469297640538,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554828230661217,
"Nucleotide GTR":0.0005548397487434467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "TTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556624627871544,
"Nucleotide GTR":0.0005550191804982065,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "K", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554699035383493,
"Nucleotide GTR":0.0005548268441724222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCC", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435474_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555860044177617,
"Nucleotide GTR":0.0005549428106435477,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTT", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554174859159596,
"Nucleotide GTR":0.0005547744872331455,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAG", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005556150504161874,
"Nucleotide GTR":0.0005549718230158466,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111530300891085,
"Nucleotide GTR":0.001110243498553195,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "T", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "G", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "ACT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "GGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435594_California_20200304_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435594_California_20200304_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554618391986052,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891686459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "P", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "CCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435620_California_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435631_California_20200311_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435640_California_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435668_California_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555707526764496,
"Nucleotide GTR":0.0005549275765589537,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "I", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "ATT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435668_California_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACN", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552958656839391,
"Nucleotide GTR":0.0005546530077990847,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554187591706149,
"Nucleotide GTR":0.0005547757590137725,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "S", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "TCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436073_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":9.213939277052931e-05,
"Nucleotide GTR":9.203272434598532e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436073_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555470092064022,
"Nucleotide GTR":0.0005549038605763727,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "T", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "ACA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":9.21393870733721e-05,
"Nucleotide GTR":9.203271865542376e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_493":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_493",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436244_Comunitat_Valenciana_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436244_Comunitat_Valenciana_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTG", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555776572943883,
"Nucleotide GTR":0.0005549344731835171,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "I", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ATA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "ILVF", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "NTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011502876,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118270879,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "A", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "GCA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "DAGV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GNT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "KN", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAN", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436365_Comunitat_Valenciana_20200321_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436365_Comunitat_Valenciana_20200321_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436384_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":7.581598607786567e-05,
"Nucleotide GTR":7.57282150220014e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436384_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553762790156145,
"Nucleotide GTR":0.0005547333280374251,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0005555971445826407,
"Nucleotide GTR":0.0005549539379116215,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "KTRI", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ANA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "TPAS", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "NCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "LF", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTN", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "QH", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAN", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "QPRL", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CNA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "KQE", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "NAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554094011571952,
"Nucleotide GTR":0.0005547664118339878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "R", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AGA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005552746100982557,
"Nucleotide GTR":0.0005546317768206814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "RS", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGN", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618391874846,
"Nucleotide GTR":0.0005548187891575381,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCC", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005552959182378329,
"Nucleotide GTR":0.000554653060292138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "S", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "TCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "SRGC", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "NGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436464_Alaska_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005556025988031366,
"Nucleotide GTR":0.0005549593858178459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436464_Alaska_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436503_Pennsylvania_20200301_null_1075":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436503_Pennsylvania_20200301_null_1075",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555776572943883,
"Nucleotide GTR":0.0005549344731835171,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436554_Florida_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436554_Florida_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436605_Wisconsin_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552745591787581,
"Nucleotide GTR":0.0005546317259601332,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "F", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTT", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436605_Wisconsin_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436621_Wisconsin_20200425_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436621_Wisconsin_20200425_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":9.1273374445242e-05,
"Nucleotide GTR":9.116770859742034e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "V", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "GTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436643_California_20200422_null_12695":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436643_California_20200422_null_12695",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436648_California_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "ILVF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "NTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436648_California_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554618390582678,
"Nucleotide GTR":0.0005548187890284704,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGC", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "DAGV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GNT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":13363.52623245724,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03290055573040425],
[0.01229620230935328],
[0.01087452355621309],
[0.03957505119473027],
[0.02471715194166132],
[0.009237749759491903],
[0.008169687261048329],
[0.02973149029744838],
[0.01802487857017096],
[0.006736589962689526],
[0.005957709900567577],
[0.02168156361973244],
[0.0262384105142831],
[0.009806302562279635],
[0.008672504365981874],
[0.03156136473438055],
[0.01846487319872533],
[0.006901032867911746],
[0.006103140026187005],
[0.02221081941994234],
[0.01387207803346111],
[0.005184528776604879],
[0.004585096999109126],
[0.01668628952197858],
[0.01011615426644767],
[0.003780795694521222],
[0.003343662604674767],
[0.01216840609833482],
[0.0147258583427091],
[0.005503619295813152],
[0.004867294484185891],
[0.01771327519736998],
[0.03380395464550526],
[0.01263383720881082],
[0.0111731213325979],
[0.04066172154180125],
[0.02539584711117326],
[0.009491404232051082],
[0.008394014371776282],
[0.03054787152514386],
[0.01851981415358641],
[0.00692156641456599],
[0.006121299497799985],
[0.02227690617905763],
[0.02695887711633119],
[0.0100755686247896],
[0.008910638064987951],
[0.03242799151399441],
[0.01223823815003388],
[0.03938849484872904],
[0.02460063556554587],
[0.009194203111076346],
[0.008131175447231725],
[0.02959133638674916],
[0.006704833753411007],
[0.005929625323137308],
[0.02157935697280764],
[0.02611472294237474],
[0.009760075762349557],
[0.008631622277990721],
[0.03141258481617688]
],
"Log Likelihood":-6033.439205656434,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.590135962517471, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":647
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":14429.8025512794,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3033204468933349],
[0.1867153234829106],
[0.1946698987819162],
[0.3152943308418382]
],
"Log Likelihood":-6152.716339335779,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2102590113780808,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1462828511045889,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.01887512573892449,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.507078232524479,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.9358715813477365
},
"display order":0,
"estimated parameters":1061
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-07/sequences.helicase.compressed.fas",
"number of sequences":528,
"number of sites":601,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6,epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3,epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1,epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1,epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2,epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1,epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3,epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1,epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21,epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1,epi_isl_413749_China_20200201_null_1,epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4,epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1,(epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1,epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1)Node1007,epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6,epi_isl_425435_England_20200401_null_4,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2,epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_6,epi_isl_433888_England_20200409_null_1,epi_isl_424144_England_20200321_null_1,epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2,epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33,(epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2,epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10)Node181,epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1,epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3,epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2,epi_isl_423399_England_20200329_null_3,epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1,epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2,epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2,epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7,epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_435668_California_20200320_null_1,(epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_36)Node165,epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3,epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_425259_England_20200101_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_436605_Wisconsin_20200414_null_3,epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3,epi_isl_423147_England_20200323_null_1,epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3,epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4,epi_isl_417231_England_20200303_null_1,(epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3,epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1,epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69)Node143,epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13,epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2,epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2,epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2,epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1,epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_432566_England_20200403_null_10,epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_435620_California_20200309_null_3,epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1,epi_isl_423598_England_20200321_null_1,epi_isl_425505_England_20200318_null_1,epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1,epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1,(epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2,epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1)Node256,epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5,epi_isl_418697_England_20200316_null_1,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1,epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_421864_England_20200327_null_1,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3,epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2,epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2,(epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1)Node505,(epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1,epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_4)Node502,(epi_isl_406036_California_20200122_null_1,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node499,(epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8)Node496,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424088_England_20200313_null_6)Node464,(epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1)Node461,epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1,epi_isl_421915_England_20200327_null_2,epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1,epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200401_null_1,epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1,epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2,epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1,epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1,epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1,epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3,epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5,epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2,epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_424142_England_20200321_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_1,epi_isl_424026_England_20200319_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423593_England_20200402_null_1,epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1,epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2,epi_isl_420528_England_20200327_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1,epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_418732_England_20200313_null_1,epi_isl_420542_England_20200322_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,(epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1)Node364,epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1,((epi_isl_423453_England_20200329_null_7,epi_isl_434013_England_20200414_null_3)Node376,epi_isl_421906_England_20200327_null_1)Node375,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node380,epi_isl_420634_England_20200320_null_1,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,(epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4,epi_isl_433804_England_20200406_null_1)Node398,(epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17,epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2,epi_isl_423385_England_20200328_null_1)Node390,(epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3)Node395,epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1,((epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2)Node407,epi_isl_421880_England_20200326_null_2)Node406,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2,epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1,epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1,(epi_isl_423362_England_20200328_null_1,epi_isl_432619_England_20200330_null_10)Node493,(epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1,epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3)Node490,(epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1)Node487,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_432548_England_20200329_null_1,epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1,epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1,(epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1)Node476,epi_isl_432559_England_20200402_null_2,epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1,epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4,(epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5,epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_4)Node528,(epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7,epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1)Node525,(epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1,epi_isl_436073_New_York_20200317_null_2)Node522,(epi_isl_423409_England_20200330_null_1,epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9)Node519,((epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1,epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1)Node514,epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1)Node513,epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,(epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1,epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2)Node54,epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4,(epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4)Node532,(epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1,epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2)Node535,(epi_isl_423404_England_20200330_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2)Node540,(epi_isl_423112_England_20200324_null_2,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3)Node543,(epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1,epi_isl_417261_England_20200306_null_1)Node556,(epi_isl_423282_England_20200326_null_1,epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_1)Node553,(epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3,epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6)Node549,epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1,(epi_isl_423145_England_20200324_null_1,epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4)Node567,epi_isl_423875_England_20200318_null_2,(epi_isl_418731_England_20200313_null_2,epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16)Node562,epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7,epi_isl_423736_England_20200323_null_1,(epi_isl_423656_England_20200322_null_1,epi_isl_435594_California_20200304_null_12)Node614,epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1,((epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1,epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_433922_England_20200411_null_1,(epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_433908_England_20200411_null_2)Node594,epi_isl_433904_England_20200410_null_1)Node579,epi_isl_423155_England_20200323_null_1)Node578,((epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7,epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1)Node600,epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1)Node599,epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1,epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1,(epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2)Node610,(epi_isl_433673_England_20200403_null_2,epi_isl_433866_England_20200408_null_3)Node606,epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3,(epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_436621_Wisconsin_20200425_null_12)Node618,epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1,epi_isl_423907_England_20200318_null_3,((epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1)Node829,epi_isl_415149_England_20200301_null_1)Node828,((epi_isl_423779_England_20200323_null_1,epi_isl_429001_California_20200325_null_1,epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_433895_England_20200410_null_49)Node815,epi_isl_423954_England_20200320_null_2)Node814,((epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_434004_England_20200414_null_4)Node810,epi_isl_423709_England_20200323_null_1)Node809,((epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2,epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1)Node805,epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2)Node804,(epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18,((((epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1,epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3)Node792,epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1)Node791,epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4,epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1,epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2,epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4,epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1,epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2,(epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2,epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1)Node782,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1,epi_isl_416682_USA_20200309_null_1,epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1,epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1,epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1,epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1,epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2,epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1,epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1,epi_isl_417368_USA_20200313_null_2,epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1,epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1,(epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1)Node767,epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1,(epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1,epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9)Node758,epi_isl_429061_California_20200408_null_1,epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1,epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1,epi_isl_429041_California_20200328_null_1,epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1,(epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9)Node748,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1,epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1,epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1,epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1,epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1,epi_isl_417324_California_20200304_null_1,epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1,epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1,epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1,epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6)Node763,epi_isl_436503_Pennsylvania_20200301_null_1075)Node689,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4)Node688,((epi_isl_413931_California_20200305_null_2,epi_isl_435631_California_20200311_null_6)Node798,epi_isl_435640_California_20200312_null_2)Node797)Node685,(epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7)Node682,(epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_423121_England_20200324_null_1)Node679,(epi_isl_433853_England_20200408_null_1,epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2)Node676,(epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2,epi_isl_433741_England_20200326_null_18)Node673,(epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_436554_Florida_20200417_null_6)Node670,(epi_isl_423061_England_20200323_null_1,epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_436200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_493,epi_isl_422003_England_20200331_null_1,epi_isl_423062_England_20200323_null_1,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_423743_England_20200323_null_1,epi_isl_425255_England_20200331_null_1,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,(epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7,epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2)Node651,epi_isl_421939_England_20200401_null_2)Node638,(epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2,epi_isl_436365_Comunitat_Valenciana_20200321_null_19)Node667,epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1,epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1,epi_isl_433832_England_20200407_null_2,((epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18)Node121,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6)Node120,epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7,epi_isl_436464_Alaska_20200407_null_7,epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node76,epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,(epi_isl_432456_England_20200405_null_1,epi_isl_433900_England_20200410_null_2)Node824,epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11,(epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4,epi_isl_433981_England_20200413_null_1)Node834,epi_isl_432466_England_20200401_null_7,(((epi_isl_423870_England_20200318_null_1,epi_isl_423888_England_20200318_null_2)Node841,epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9)Node840,epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1)Node839,(epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1,epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1)Node847,epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5,epi_isl_421931_England_20200331_null_1,(epi_isl_429643_USA_20200408_null_1,epi_isl_436244_Comunitat_Valenciana_20200319_null_3)Node854,(epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1)Node857,epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1,(epi_isl_423312_England_20200325_null_1,epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4)Node867,(epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1)Node863,epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_33,epi_isl_423758_England_20200322_null_1,epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1,(epi_isl_423570_England_20200401_null_1,epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1)Node873,epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8)Node878,epi_isl_436643_California_20200422_null_12695,epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1,(epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1,epi_isl_436384_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1)Node884,epi_isl_435474_California_20200429_null_1,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2,(epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1)Node892,epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,(epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3)Node900,(epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5,epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1)Node903,epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7,(epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1,epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1)Node913,epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1,epi_isl_432847_England_20200406_null_2,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1,epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4,epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1,(epi_isl_433771_England_20200405_null_1,epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1)Node932,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2,epi_isl_433809_England_20200407_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_433902_England_20200409_null_2,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1,epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4,epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1,(epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1)Node963,(epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2)Node960,epi_isl_423339_England_20200327_null_1,(epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12)Node953,(epi_isl_423089_England_20200323_null_3,epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_29)Node956,epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_433687_England_20200101_null_1,epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15,epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1,epi_isl_436648_California_20200422_null_1,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5,epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4,epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1,epi_isl_429011_California_20200408_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3,epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1,(epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1)Node100,epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1,epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16,epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1)Node1,epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node100":"test",
"Node1007":"test",
"Node120":"test",
"Node121":"test",
"Node143":"test",
"Node165":"test",
"Node181":"test",
"Node256":"test",
"Node364":"test",
"Node375":"test",
"Node376":"test",
"Node380":"test",
"Node390":"test",
"Node395":"test",
"Node398":"test",
"Node406":"test",
"Node407":"test",
"Node461":"test",
"Node464":"test",
"Node476":"test",
"Node487":"test",
"Node490":"test",
"Node493":"test",
"Node496":"test",
"Node499":"test",
"Node502":"test",
"Node505":"test",
"Node513":"test",
"Node514":"test",
"Node519":"test",
"Node522":"test",
"Node525":"test",
"Node528":"test",
"Node532":"test",
"Node535":"test",
"Node54":"test",
"Node540":"test",
"Node543":"test",
"Node549":"test",
"Node553":"test",
"Node556":"test",
"Node562":"test",
"Node567":"test",
"Node578":"test",
"Node579":"test",
"Node594":"test",
"Node599":"test",
"Node600":"test",
"Node606":"test",
"Node610":"test",
"Node614":"test",
"Node618":"test",
"Node638":"test",
"Node651":"test",
"Node667":"test",
"Node670":"test",
"Node673":"test",
"Node676":"test",
"Node679":"test",
"Node682":"test",
"Node685":"test",
"Node688":"test",
"Node689":"test",
"Node748":"test",
"Node758":"test",
"Node76":"test",
"Node763":"test",
"Node767":"test",
"Node782":"test",
"Node791":"test",
"Node792":"test",
"Node797":"test",
"Node798":"test",
"Node804":"test",
"Node805":"test",
"Node809":"test",
"Node810":"test",
"Node814":"test",
"Node815":"test",
"Node824":"test",
"Node828":"test",
"Node829":"test",
"Node834":"test",
"Node839":"test",
"Node840":"test",
"Node841":"test",
"Node847":"test",
"Node854":"test",
"Node857":"test",
"Node863":"test",
"Node867":"test",
"Node873":"test",
"Node878":"test",
"Node884":"test",
"Node892":"test",
"Node900":"test",
"Node903":"test",
"Node913":"test",
"Node932":"test",
"Node953":"test",
"Node956":"test",
"Node960":"test",
"Node963":"test",
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":"test",
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"test",
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420542_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":"test",
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":"test",
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":"test",
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":"test",
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":"test",
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":"test",
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":"test",
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":"test",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":"test",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":"test",
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":"test",
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":"test",
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12":"test",
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_432466_England_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_432559_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432566_England_20200403_null_10":"test",
"epi_isl_432619_England_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_432847_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":"test",
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15":"test",
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4":"test",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10":"test",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":"test",
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433741_England_20200326_null_18":"test",
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433832_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_433895_England_20200410_null_49":"test",
"epi_isl_433900_England_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_433902_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434004_England_20200414_null_4":"test",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":"test",
"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13":"test",
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8":"test",
"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11":"test",
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69":"test",
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8":"test",
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16":"test",
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9":"test",
"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16":"test",
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9":"test",
"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118":"test",
"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7":"test",
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_435594_California_20200304_null_12":"test",
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":"test",
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_435668_California_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_436050_New_York_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_436073_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_29":"test",
"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4":"test",
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_436200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_493":"test",
"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_436244_Comunitat_Valenciana_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436365_Comunitat_Valenciana_20200321_null_19":"test",
"epi_isl_436384_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_36":"test",
"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_33":"test",
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_436459_Madhya_Pradesh_20200420_null_6":"test",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436464_Alaska_20200407_null_7":"test",
"epi_isl_436503_Pennsylvania_20200301_null_1075":"test",
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_436554_Florida_20200417_null_6":"test",
"epi_isl_436605_Wisconsin_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_436621_Wisconsin_20200425_null_12":"test",
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_436643_California_20200422_null_12695":"test",
"epi_isl_436648_California_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":32
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":24
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":56
}
}
}